RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 CDHR1Q96JP9 859 aa16.47■□□□□ 0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RARAP10276 462 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ECE1P42892 770 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 YARSP54577 528 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 TSC22D3Q99576 134 aa16.47■□□□□ 0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16.46■□□□□ 0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 HES6Q96HZ4 224 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16.46■□□□□ 0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 STRIP1Q5VSL9 837 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PCGF5Q86SE9 256 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 FLAD1Q8NFF5 587 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ACER1Q8TDN7 264 aa16.46■□□□□ 0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
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PTPRU-201ENST00000345512 WHRNQ9P202 907 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 GRIN2DO15399 1336 aa16.46■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 ACP6Q9NPH0 428 aa16.45■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.45■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16.45■□□□□ 0.22
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PTPRU-201ENST00000345512 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 LRRC15Q8TF66 581 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 KAT5Q92993 513 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 HESX1Q9UBX0 185 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 ZHX2Q9Y6X8 837 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 MEIS2O14770 477 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRU-201ENST00000345512 PRPSAP2O60256 369 aa16.44■□□□□ 0.22
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