RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SORBS3O60504 671 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 GARTP22102 1010 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 CENPCQ03188 943 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC25Q86WR0 208 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 BSNDQ8WZ55 320 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 DCLK3Q9C098 648 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 VEZTQ9HBM0 779 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 MGRN1O60291 552 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ATP9AO75110 1047 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 TTC4O95801 387 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 GAS8O95995 478 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 RTP1P59025 263 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 GPD1LQ8N335 351 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 MTFR1LQ9H019 292 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 CHST7Q9NS84 486 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ASIC3Q9UHC3 531 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 MYPNQ86TC9 1320 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 CLDN10P78369 228 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 CHADLQ6NUI6 762 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 CD248Q9HCU0 757 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 NEU2Q9Y3R4 380 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 SNX3O60493 162 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 SCP2P22307 547 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 LONRF1Q17RB8 773 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 RELL1Q8IUW5 271 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 TRAIPQ9BWF2 469 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 PXMP2Q9NR77 195 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ARID2Q68CP9 1835 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
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HOXD1-201ENST00000331462 CHKAP35790 457 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 BPIFB4P59827 614 aa24.05■■□□□ 1.44
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HOXD1-201ENST00000331462 WLSQ5T9L3 541 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 VSTM1Q6UX27 236 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 RPAINQ86UA6 219 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 LGALS13Q9UHV8 139 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ACSL3O95573 720 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ATL2Q8NHH9 583 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 HERPUD2Q9BSE4 406 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 PSTPIP1O43586 416 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 RAD17O75943 681 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 PROSCO94903 275 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 STBD1O95210 358 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ATF2P15336 505 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 RRM1P23921 792 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ABCD1P33897 745 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ITGA8P53708 1063 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC38Q502W7 563 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 FAM228AQ86W67 206 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 CPXCR1Q8N123 301 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 RMDN3Q96TC7 470 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 COL4A5P29400 1685 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM120BA0PK00 339 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 CFAP73A6NFT4 308 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 IFNAR2P48551 515 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 SNX1Q13596 522 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 MON1BQ7L1V2 547 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 BBOF1Q8ND07 529 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ATG4AQ8WYN0 398 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 KCNN1Q92952 543 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM7Q9C029 511 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXD1-201ENST00000331462 ATP2C2O75185 946 aa24.02■■□□□ 1.44
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