RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa12.15□□□□□ -0.46
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PGA3-201ENST00000325558 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
PGA3-201ENST00000325558 ASS1P00966 412 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
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PGA3-201ENST00000325558 PRKCBP05771 671 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGA3-201ENST00000325558 UVRAGQ9P2Y5 699 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGA3-201ENST00000325558 TNFSF13BQ9Y275 285 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGA3-201ENST00000325558 GH1P01241 217 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGA3-201ENST00000325558 INSRRP14616 1297 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGA3-201ENST00000325558 EFCAB12Q6NXP0 572 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGA3-201ENST00000325558 EMBQ6PCB8 327 aa12.14□□□□□ -0.47
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PGA3-201ENST00000325558 NCOA4Q13772 614 aa12.13□□□□□ -0.47
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PGA3-201ENST00000325558 MPZL3Q6UWV2 235 aa12.13□□□□□ -0.47
PGA3-201ENST00000325558 GPR142Q7Z601 462 aa12.13□□□□□ -0.47
PGA3-201ENST00000325558 IFT20Q8IY31 132 aa12.13□□□□□ -0.47
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PGA3-201ENST00000325558 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP12.13□□□□□ -0.47
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PGA3-201ENST00000325558 COMTP21964 271 aa12.12□□□□□ -0.47
PGA3-201ENST00000325558 PIK3CAP42336 1068 aa12.12□□□□□ -0.47
PGA3-201ENST00000325558 CARSP49589 748 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PGA3-201ENST00000325558 DNA2P51530 1060 aa12.12□□□□□ -0.47
PGA3-201ENST00000325558 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PGA3-201ENST00000325558 TNNC1P63316 161 aa12.12□□□□□ -0.47
PGA3-201ENST00000325558 TFDP1Q14186 410 aa12.12□□□□□ -0.47
PGA3-201ENST00000325558 FAM110CQ1W6H9 321 aa12.12□□□□□ -0.47
PGA3-201ENST00000325558 DUSP28Q4G0W2 176 aa12.12□□□□□ -0.47
PGA3-201ENST00000325558 RHPN2Q8IUC4 686 aa12.12□□□□□ -0.47
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