RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SugctQ7TNE1 436 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Znf12Q7TSI0 686 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Wdr3Q8BHB4 942 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pnpla2Q8BJ56 486 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Iqsec1Q8R0S2 961 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn1r218Q8R261 298 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc91Q9D8L5 442 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mgat1P27808 447 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gjb1P28230 283 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 BbxQ8VBW5 907 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Map4k3Q99JP0 894 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TtpalQ9D3D0 343 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rsph3bQ9DA80 389 aa21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm14525B1AZA0 212 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm2012B1B0R1 212 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tap2P36371 702 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AdkP55264 361 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm14819Q62478 212 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf225Q9D7D1 332 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf138rt1Q9D9M9 248 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm11985A0A1B0GS61 206 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hoxc8P09025 242 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Oaz1P54369 227 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PltpP55065 493 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rad54lP70270 747 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Upf3bQ3ULL6 472 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fscn1Q61553 493 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc20a2Q80UP8 656 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cog3Q8CI04 820 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Usp15Q8R5H1 981 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Golph3Q9CRA5 298 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc35g2D3YVE8 412 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SprtnG3X912 497 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gjc1P28229 396 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mybl1P51960 751 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atp9bP98195 1146 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 RetsatQ64FW2 609 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 VcpkmtQ8C436 228 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CalcbQ99MP3 130 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hsd3b7Q9EQC1 369 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fbxo16Q9QZM9 334 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm8994E9PV04 411 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 StrnO55106 780 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ass1P16460 412 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PuraP42669 321 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppp1r12cQ3UMT1 782 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam49aQ8BHZ0 323 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Phka2Q8BWJ3 1235 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Elmo3Q8BYZ7 720 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc28aQ8CEI3 192 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ankrd2Q9WV06 328 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cd97Q9Z0M6 818 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arhgef10Q8C033 1345 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gon4lQ9DB00 2260 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Skint7A7XV04 395 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm4846B2RWH8 538 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PrkcshO08795 521 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PrphP15331 475 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rhox5P52651 210 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 GaaP70699 953 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hace1Q3U0D9 909 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Palb2Q3U0P1 1104 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sema5aQ62217 1077 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 C6.1alQ7M757 291 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q922R1 422 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rasgef1cQ9D300 466 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dnajc12Q9R022 198 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm28036V9GXJ1 658 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cetn1P41209 172 aa21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc1a1P51906 523 aa21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Psmc4P54775 418 aa21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sh3bp2Q06649 559 aa21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vav2Q60992 868 aa21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Myef2Q8C854 591 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Commd10Q8JZY2 202 aa21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kct2Q8K201 259 aa21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fbxo33Q8VE08 562 aa21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pidd1Q9ERV7 915 aa21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gadd45gQ9Z111 159 aa21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ankrd16A2AS55 361 aa21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nr3c1P06537 783 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 69.9 ms