Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
Hoxc8P09025 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Hoxc8P09025 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Hoxc8P09025 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Hoxc8P09025 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Hoxc8P09025 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Hoxc8P09025 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Hoxc8P09025 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Hoxc8P09025 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Hoxc8P09025 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Hoxc8P09025 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Hoxc8P09025 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Hoxc8P09025 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Hoxc8P09025 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Hoxc8P09025 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Hoxc8P09025 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Hoxc8P09025 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Hoxc8P09025 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Hoxc8P09025 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Hoxc8P09025 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Hoxc8P09025 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Hoxc8P09025 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Hoxc8P09025 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Hoxc8P09025 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Hoxc8P09025 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Hoxc8P09025 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Hoxc8P09025 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Hoxc8P09025 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Hoxc8P09025 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Hoxc8P09025 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Hoxc8P09025 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Hoxc8P09025 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxc8P09025 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Hoxc8P09025 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Hoxc8P09025 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hoxc8P09025 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Hoxc8P09025 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Hoxc8P09025 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Hoxc8P09025 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hoxc8P09025 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Hoxc8P09025 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Hoxc8P09025 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Hoxc8P09025 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Hoxc8P09025 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hoxc8P09025 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Hoxc8P09025 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Hoxc8P09025 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hoxc8P09025 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hoxc8P09025 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Hoxc8P09025 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hoxc8P09025 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hoxc8P09025 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hoxc8P09025 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hoxc8P09025 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Hoxc8P09025 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hoxc8P09025 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Hoxc8P09025 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Hoxc8P09025 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hoxc8P09025 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Hoxc8P09025 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Hoxc8P09025 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Hoxc8P09025 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Hoxc8P09025 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hoxc8P09025 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Hoxc8P09025 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Hoxc8P09025 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hoxc8P09025 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Hoxc8P09025 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Hoxc8P09025 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Hoxc8P09025 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Hoxc8P09025 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Hoxc8P09025 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hoxc8P09025 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Hoxc8P09025 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Hoxc8P09025 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hoxc8P09025 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hoxc8P09025 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Hoxc8P09025 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Hoxc8P09025 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hoxc8P09025 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hoxc8P09025 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Hoxc8P09025 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Hoxc8P09025 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Hoxc8P09025 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Hoxc8P09025 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxc8P09025 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxc8P09025 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Hoxc8P09025 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hoxc8P09025 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hoxc8P09025 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Hoxc8P09025 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Hoxc8P09025 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Hoxc8P09025 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Hoxc8P09025 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Hoxc8P09025 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hoxc8P09025 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Hoxc8P09025 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Hoxc8P09025 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Hoxc8P09025 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Hoxc8P09025 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms