RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000056749.13

Nhlrc3-201, Transcript of NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nhlrc3, Length 5,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Q8BGN9 141 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 AdigQ8R400 80 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Myh1Q5SX40 1942 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Nptx2O70340 429 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prl2c3P04768 224 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gfpt1P47856 697 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ptgs2Q05769 604 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gm13103Q4VAD2 491 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 ErfeQ6PGN1 340 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Spag7Q7TNE3 227 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Apol7cQ8C6E1 369 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 1700123K08RikQ9D991 295 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tfr2Q9JKX3 798 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Zkscan5Q9Z1D8 819 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Siglec1Q62230 1695 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Slc16a6B1AT66 607 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Lonrf2B2RT44 518 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Usp35M0QWN7 1009 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 AlbP07724 608 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pou6f1Q07916 301 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cnga4Q3UW12 575 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tas2r115Q7M719 310 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pcsk9Q80W65 694 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Llgl1Q80Y17 1036 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PlvapQ91VC4 438 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tc2nQ91XT6 489 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tmed2Q9R0Q3 201 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gm8113E0CXS8 587 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 AgtP11859 477 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 GlrbP48168 496 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gxylt1Q3UHH8 404 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tmem26Q3UP23 366 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Fam8a1Q3URQ4 399 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Spata17Q9D552 379 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Sept3Q9Z1S5 350 aa11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Syndig1A2ANU3 258 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Olfr743L7N1Y2 311 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ap1m1P35585 423 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Vav2Q60992 868 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 FsbpQ8BKE5 299 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pop1Q8K205 1045 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Washc1Q8VDD8 475 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Trmt11Q9CWH5 460 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Snx2Q9CWK8 519 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Rab27aQ9ERI2 221 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Kndc1Q0KK55 1742 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Ces1bD3Z5G7 567 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PbsnO08976 174 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Lsp1P19973 330 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cd19P25918 547 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Sh3bp1P55194 680 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Dpf3P58269 378 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cdo1P60334 200 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Stx1bP61264 288 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Olfr698Q7TRN4 311 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Pnma3Q8JZW8 466 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cyp2c50Q91X77 490 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Rassf7Q9DD19 359 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tet3Q8BG87 1668 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Krt90E9Q1Z0 538 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Nedd9O35177 833 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Hoxa11P31311 313 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Meis2P97367 477 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Irf6P97431 467 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Smarca1Q6PGB8 1046 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Usp17leQ7M764 540 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Prkag3Q8BGM7 489 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 EtnpplQ8BWU8 499 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Calhm6Q8C9E8 313 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cpa5Q8R4H4 436 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 NenfQ9CQ45 171 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Snx1Q9WV80 522 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Gm8994E9PV04 411 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Oas1aP11928 367 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Resp18P47939 175 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Mgat3Q10470 538 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Fam92bQ3V2J0 292 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Mtrf1lQ8BJU9 373 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Tsen34Q8BMZ5 316 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Armc6Q8BNU0 468 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Suds3Q8BR65 328 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 PdxkQ8K183 312 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Oas1gQ8K469 367 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Haus3Q8QZX2 570 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Vps39Q8R5L3 886 aa11.88□□□□□ -0.51
Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 Spc24Q9D083 201 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.9 ms