Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Snx1Q9WV80 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Snx1Q9WV80 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Snx1Q9WV80 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Snx1Q9WV80 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Snx1Q9WV80 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Snx1Q9WV80 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Snx1Q9WV80 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Snx1Q9WV80 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Snx1Q9WV80 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Snx1Q9WV80 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Snx1Q9WV80 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Snx1Q9WV80 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Snx1Q9WV80 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Snx1Q9WV80 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Snx1Q9WV80 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Snx1Q9WV80 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Snx1Q9WV80 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Snx1Q9WV80 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Snx1Q9WV80 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Snx1Q9WV80 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Snx1Q9WV80 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Snx1Q9WV80 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Snx1Q9WV80 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Snx1Q9WV80 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Snx1Q9WV80 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Snx1Q9WV80 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Snx1Q9WV80 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Snx1Q9WV80 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Snx1Q9WV80 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Snx1Q9WV80 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Snx1Q9WV80 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Snx1Q9WV80 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Snx1Q9WV80 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Snx1Q9WV80 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Snx1Q9WV80 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Snx1Q9WV80 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Snx1Q9WV80 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Snx1Q9WV80 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Snx1Q9WV80 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Snx1Q9WV80 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Snx1Q9WV80 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Snx1Q9WV80 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snx1Q9WV80 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snx1Q9WV80 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snx1Q9WV80 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Snx1Q9WV80 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Snx1Q9WV80 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Snx1Q9WV80 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Snx1Q9WV80 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Snx1Q9WV80 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Snx1Q9WV80 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Snx1Q9WV80 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Snx1Q9WV80 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Snx1Q9WV80 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Snx1Q9WV80 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Snx1Q9WV80 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Snx1Q9WV80 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Snx1Q9WV80 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snx1Q9WV80 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snx1Q9WV80 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snx1Q9WV80 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snx1Q9WV80 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Snx1Q9WV80 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Snx1Q9WV80 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snx1Q9WV80 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Snx1Q9WV80 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snx1Q9WV80 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snx1Q9WV80 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snx1Q9WV80 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snx1Q9WV80 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snx1Q9WV80 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snx1Q9WV80 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Snx1Q9WV80 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Snx1Q9WV80 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Snx1Q9WV80 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snx1Q9WV80 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snx1Q9WV80 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Snx1Q9WV80 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snx1Q9WV80 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snx1Q9WV80 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx1Q9WV80 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snx1Q9WV80 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Snx1Q9WV80 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snx1Q9WV80 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snx1Q9WV80 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snx1Q9WV80 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snx1Q9WV80 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snx1Q9WV80 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snx1Q9WV80 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snx1Q9WV80 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snx1Q9WV80 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snx1Q9WV80 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snx1Q9WV80 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snx1Q9WV80 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snx1Q9WV80 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx1Q9WV80 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx1Q9WV80 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snx1Q9WV80 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snx1Q9WV80 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms