RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055131.12

Usp48-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp48, Length 5,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rab6bP61294 208 aa18.25■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dnajc7Q9QYI3 494 aa18.25■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Plod1Q9R0E2 728 aa18.25■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rabgap1lA6H6A9 815 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Lzts1P60853 599 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 TrabdQ99JY4 376 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Josd2Q9CR30 188 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Anxa9Q9JHQ0 345 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm10436L7N1Y3 520 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ksr1Q61097 873 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ccnt2Q7TQK0 723 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Celf4Q7TSY6 486 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 LzicQ8K3C3 190 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fmnl1Q9JL26 1094 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Wdr19Q3UGF1 1341 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tal1P22091 329 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vps33bP59016 617 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Myo19Q5SV80 963 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Got1P05201 413 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 VcpQ01853 806 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Capn13Q3UW68 665 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Spag6Q3V0U9 509 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mad2l2Q9D752 211 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mms22lB1AUR6 1238 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 FntaQ61239 377 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mcf2lQ64096 1149 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 ArcQ9WV31 396 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 M1apQ9Z0E1 529 aa18.24■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dip2cE9PWR4 1557 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Serpina1aP07758 413 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Serpina1cQ00896 412 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Serpina1dQ00897 413 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ap5z1Q3U829 807 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vipas39Q8BGQ1 491 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prr33Q8C494 260 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Golph3Q9CRA5 298 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gipc2Q9Z2H7 314 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Sdccag3A2AIW0 432 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Kifc3O35231 824 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Men1O88559 611 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fgd3O88842 733 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc2a4P14142 509 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 LtbrP50284 415 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tfdp2Q64163 446 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm2163Q6PCY5 473 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 ZwilchQ8R060 589 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tjap1Q9DCD5 539 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 PalmdQ9JHU2 551 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tbk1Q9WUN2 729 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cul7Q8VE73 1689 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cyp2d11P24457 504 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Msr1P30204 458 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ppp4r3cQ3V0Y1 813 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fam107aQ78TU8 144 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 CenpuQ8C4M7 410 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vps33aQ9D2N9 598 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pcdh11xF6ZNL5 1338 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zfp212G3X8R7 492 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Akr1b10G5E895 316 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fam89aQ14BJ1 175 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Kcnk18Q6VV64 394 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Chmp2bQ8BJF9 213 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gyg1Q9R062 333 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Eif2ak3Q9Z2B5 1114 aa18.23■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm8879F6R3J9 157 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm1604bQ3TRG0 118 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Myo1dQ5SYD0 1006 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Daam1Q8BPM0 1077 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Stk33Q924X7 491 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 PolgP54099 1218 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 RalaP63321 206 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Spdye4aQ5IBH6 268 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tfe3Q64092 572 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ppargc1aO70343 797 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rnf10Q3UIW5 804 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem145Q8C4U2 746 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ints5Q8CHT3 1018 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Abtb1Q99LJ2 478 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Usp13Q5BKP2 858 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Elmo2Q8BHL5 732 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Epc2Q8C0I4 808 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 OoepQ9CWE6 164 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc25a13Q9QXX4 676 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 PtsQ9R1Z7 144 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 1700003F12RikA2AKE5 210 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Psd3Q2PFD7 1037 aa18.22■□□□□ 0.51
Usp48-201ENSMUST00000055131 Stx3Q64704 289 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.9 ms