Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Sdccag3A2AIW0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Sdccag3A2AIW0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sdccag3A2AIW0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sdccag3A2AIW0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Sdccag3A2AIW0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Sdccag3A2AIW0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sdccag3A2AIW0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sdccag3A2AIW0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Sdccag3A2AIW0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sdccag3A2AIW0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sdccag3A2AIW0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Sdccag3A2AIW0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sdccag3A2AIW0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sdccag3A2AIW0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sdccag3A2AIW0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Sdccag3A2AIW0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sdccag3A2AIW0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sdccag3A2AIW0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sdccag3A2AIW0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Sdccag3A2AIW0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sdccag3A2AIW0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sdccag3A2AIW0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sdccag3A2AIW0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sdccag3A2AIW0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sdccag3A2AIW0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sdccag3A2AIW0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sdccag3A2AIW0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sdccag3A2AIW0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sdccag3A2AIW0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sdccag3A2AIW0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sdccag3A2AIW0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sdccag3A2AIW0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sdccag3A2AIW0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sdccag3A2AIW0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sdccag3A2AIW0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sdccag3A2AIW0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sdccag3A2AIW0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sdccag3A2AIW0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sdccag3A2AIW0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sdccag3A2AIW0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sdccag3A2AIW0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sdccag3A2AIW0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sdccag3A2AIW0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sdccag3A2AIW0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sdccag3A2AIW0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Sdccag3A2AIW0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sdccag3A2AIW0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sdccag3A2AIW0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sdccag3A2AIW0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sdccag3A2AIW0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sdccag3A2AIW0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sdccag3A2AIW0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sdccag3A2AIW0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sdccag3A2AIW0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sdccag3A2AIW0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sdccag3A2AIW0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sdccag3A2AIW0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sdccag3A2AIW0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sdccag3A2AIW0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sdccag3A2AIW0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sdccag3A2AIW0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sdccag3A2AIW0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sdccag3A2AIW0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sdccag3A2AIW0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdccag3A2AIW0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sdccag3A2AIW0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sdccag3A2AIW0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sdccag3A2AIW0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sdccag3A2AIW0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sdccag3A2AIW0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sdccag3A2AIW0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sdccag3A2AIW0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sdccag3A2AIW0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sdccag3A2AIW0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sdccag3A2AIW0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sdccag3A2AIW0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sdccag3A2AIW0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sdccag3A2AIW0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sdccag3A2AIW0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sdccag3A2AIW0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sdccag3A2AIW0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sdccag3A2AIW0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sdccag3A2AIW0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sdccag3A2AIW0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sdccag3A2AIW0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sdccag3A2AIW0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sdccag3A2AIW0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sdccag3A2AIW0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sdccag3A2AIW0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdccag3A2AIW0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sdccag3A2AIW0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sdccag3A2AIW0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sdccag3A2AIW0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sdccag3A2AIW0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdccag3A2AIW0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdccag3A2AIW0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sdccag3A2AIW0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sdccag3A2AIW0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sdccag3A2AIW0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms