RNA–Protein interactions for RNA: YNL165W

YNL165W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL165W, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL165W	YNL165W	RAD17	P48581	401 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	GIM3	P53900	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	GOT1	Q03554	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	SEI1	Q06058	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	SAC3	P46674	1301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	SPT3	P06844	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	YAK1	P14680	807 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	ERG28	P40030	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	CPR7	P47103	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	MCM22	P47167	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	YPS3	Q12303	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL165W	YNL165W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	TEM1	P38987	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	SUR2	P38992	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	HST4	P53688	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	TLG1	Q03322	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	CDC123	Q05791	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	IES3	Q12345	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	SPL2	P38839	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	GET4	Q12125	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	DCN1	Q12395	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	NIF3	P53081	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
YNL165W	YNL165W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	PRR2	Q12310	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	SNA3	P14359	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YIR035C	P40579	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YFR045W	P43617	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YNL194C	P40169	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	OST3	P48439	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	SFC1	P33303	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YJL028W	P47062	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YJR149W	P47177	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	TRM9	P49957	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	FYV6	P53913	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	HEM25	Q07534	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	JLP1	Q12358	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	CHD1	P32657	1468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	AST1	P35183	429 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	MGA1	P53050	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YNL046W	P53956	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	TPO4	Q12256	659 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL165W	YNL165W	ERD2	P18414	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	CAB3	P36076	571 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	ECM13	P38195	257 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	YER189W	P40104	122 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	ILM1	P47155	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	NUP57	P48837	541 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	BRR6	P53062	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	SLD7	Q08457	257 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	TIM22	Q12328	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	PST1	Q12355	444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
YNL165W	YNL165W	SLX1	P38324	304 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	YML108W	Q03759	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	PAN1	P32521	1480 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	YPK2	P18961	677 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	ECO1	P43605	281 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	EMI1	Q04406	187 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	EMP46	Q12396	444 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	URA6	P15700	204 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	PPH21	P23594	369 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	RNP1	P32385	249 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	YGL034C	P53186	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL165W	YNL165W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 900.4 ms