RNA–Protein interactions for RNA: YMR030W

RSF1, Transcript of Protein required for respiratory growth, yeast

Gene RSF1, Length 1,131 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSF1	YMR030W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	TFS1	P14306	219 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	MDH2	P22133	377 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	TIR2	P33890	251 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	ECM8	P38246	354 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	YHL044W	P38727	235 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	TOS2	P50078	622 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	VHT1	P53241	593 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	BIO4	P53630	237 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	CIK1	Q01649	594 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	MCH1	Q07376	486 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RSF1	YMR030W	GIT1	P25346	518 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	PBN1	P25580	416 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	RPB9	P27999	122 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	MRPL39	P36533	70 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YBR220C	P38318	560 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	GEP4	P38812	185 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	NSG1	P38837	291 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YHR177W	P38867	453 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	SLM2	P53955	656 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	SWP1	Q02795	286 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YPL039W	Q03080	316 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	SNX41	Q04053	625 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	API2	Q04413	109 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	MSA1	Q08471	629 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	OPI3	P05375	206 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	DBF2	P22204	572 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	TOA2	P32774	122 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YOR062C	P36025	268 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	AYR1	P40471	297 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	PMT5	P52867	743 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YIP5	P53108	310 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	INP1	Q03694	420 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	HMS1	Q12398	434 aa		3.39	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	UTR1	P21373	530 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	ECT1	P33412	323 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YER188W	P40103	239 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YFR054C	P43622	192 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	GTO1	P48239	356 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	MNT4	P53745	580 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YDR124W	Q04608	324 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	COX20	Q04935	205 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	ASA1	Q06822	443 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YOL019W	Q08157	551 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YLR053C	Q12026	108 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YDL180W	Q12301	547 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YPR096C	O13587	100 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	KSS1	P14681	368 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	EHD3	P28817	500 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	ITR2	P30606	609 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YKL102C	P34249	101 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	SBH2	P52871	88 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	IGO1	P53897	168 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	STE23	Q06010	1027 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	ARR1	Q06596	294 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	REP1	P03871	373 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	SEC17	P32602	292 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YIR020C	P40575	100 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	MOB2	P43563	287 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	PAC10	P48363	199 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	NAT4	Q04751	285 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	LDS2	Q08218	356 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	RTR2	Q12378	196 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	UNG1	P12887	359 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	CMK2	P22517	447 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	DAL80	P26343	269 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	ECM14	P38836	430 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	KEG1	P43614	200 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	NAS6	P50086	228 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	RCF2	P53721	224 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	MSC3	Q05812	728 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RSF1	YMR030W	PIN3	Q06449	215 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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