RNA–Protein interactions for RNA: YKR033C

YKR033C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR033C, Length 426 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR033CYKR033C ERG8P24521 451 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YCR016WP25617 290 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C PRE2P30656 287 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C ATS1P31386 333 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C ACP1P32463 125 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C SNC2P33328 115 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C SDS24P38314 527 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C HPA3P39979 161 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C RFC4P40339 323 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C DLS1P40366 167 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C SEC24P40482 926 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YKE4P40544 346 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YPS6P40583 537 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C MNN5P46982 586 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C RMD9P53140 646 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C SYF2P53277 215 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C SAY1P53324 424 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C ERV29P53337 310 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C HOL1P53389 586 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YNR071CP53757 342 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C MRPL19P53875 158 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C SAM50P53969 484 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C CTF19Q02732 369 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C PRM15Q03262 622 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C CGI121Q03705 181 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C BNA7Q04066 261 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C PAL1Q05518 499 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C NNT1Q05874 261 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C TAZ1Q06510 381 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C MIM1Q08176 113 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C MCH4Q08268 501 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C PEX27Q08580 376 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C TMA17Q12513 150 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C ISN1Q99312 450 aa2.49□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C CCH1P50077 2039 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C CDC36P06100 191 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C ARF1P11076 181 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C SCO1P23833 295 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C MEK1P24719 497 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C IFM1P25038 676 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C CPR4P25334 318 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C BOS1P25385 244 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C KRR1P25586 316 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YCR101CP25607 182 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YCR102CP25608 368 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C TRR1P29509 319 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C ERG9P29704 444 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C ACH1P32316 526 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C VMA8P32610 256 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C SEF1P34228 1148 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C FRM2P37261 193 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C NAT2P37293 288 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C PEX32P38292 413 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YPC1P38298 316 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C RRF1P38771 230 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C HTD2P38790 280 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C PET100P38958 111 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YER010CP40011 234 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C PUG1P40100 303 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YMR144WP40214 342 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C SLM1P40485 686 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C BMT5P40493 336 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C SPG5P42933 373 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C OCA1P50946 238 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C DOC1P53068 250 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C ORM1P53224 222 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C NRM1P53718 249 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C RSM23Q01163 450 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.48□□□□□ -2.01not detected
YKR033CYKR033C MRPL13Q02204 264 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C INP1Q03694 420 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C MSS11Q03825 758 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YDR387CQ04162 555 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C UTP15Q04305 513 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C MDM30Q05930 598 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C KEI1Q06346 221 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C MRPL35Q06678 367 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YOL029CQ08187 201 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YNG1Q08465 219 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YOR376WQ08900 122 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YOR385WQ08909 290 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C FEX1Q08913 375 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C ATG41Q12048 136 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C RDL1Q12305 139 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YOR343CQ12484 108 aa2.48□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YAL064W-BO13512 126 aa2.47□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YFR010W-AP0C5N0 62 aa2.47□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C CTA1P15202 515 aa2.47□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C URA6P15700 204 aa2.47□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C RNA14P25298 677 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C YCR006CP25350 157 aa2.47□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C MXR2P25566 168 aa2.47□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C LDB16P25587 256 aa2.47□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C NAM9P27929 486 aa2.47□□□□□ -2.01
YKR033CYKR033C ECM25P32525 599 aa2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.3 ms