RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W CLG1P35190 452 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YBR242WP38331 238 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W BOL3P39724 118 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W QDR1P40475 563 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W XBP1P40489 647 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W OTU1P43558 301 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W BXI1P48558 297 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YGL159WP53110 370 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YGR042WP53227 271 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W NRK1P53915 240 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W CTF19Q02732 369 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YPR196WQ06595 470 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W THI72Q08579 599 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W HEM4P06174 275 aa7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YCP4P25349 247 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W RNP1P32385 249 aa7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W TCM62P38228 572 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YER084WP40057 128 aa7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W GPP1P41277 250 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W UBX6P47049 396 aa7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W DIE2P50076 525 aa7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W RCE1Q03530 315 aa7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YDR391CQ04170 232 aa7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W ODC2Q99297 307 aa7.7□□□□□ -1.18
DDI1YER143W GCN3P14741 305 aa7.69□□□□□ -1.18
DDI1YER143W HXT2P23585 541 aa7.69□□□□□ -1.18
DDI1YER143W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data7.69□□□□□ -1.18not detected
DDI1YER143W FLO10P36170 1169 aa7.69□□□□□ -1.18
DDI1YER143W APL3P38065 1025 aa7.69□□□□□ -1.18
DDI1YER143W UMP1P38293 148 aa7.69□□□□□ -1.18
DDI1YER143W IDP2P41939 412 aa7.69□□□□□ -1.18
DDI1YER143W AIM25P47140 327 aa7.69□□□□□ -1.18
DDI1YER143W RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
DDI1YER143W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YOR385WQ08909 290 aa7.69□□□□□ -1.18
DDI1YER143W SCM3Q12334 223 aa7.69□□□□□ -1.18
DDI1YER143W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
DDI1YER143W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data7.68□□□□□ -1.18not detected
DDI1YER143W IPP1P00817 287 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
DDI1YER143W DSF1P0CX08 502 aa7.68□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YNR073CP0CX09 502 aa7.68□□□□□ -1.18
DDI1YER143W RPL30P14120 105 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
DDI1YER143W AGA2P32781 87 aa7.68□□□□□ -1.18
DDI1YER143W MRPL3P36516 390 aa7.68□□□□□ -1.18
DDI1YER143W MRPL36P36531 177 aa7.68□□□□□ -1.18
DDI1YER143W AVT7P40501 490 aa7.68□□□□□ -1.18
DDI1YER143W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YNR048WP53740 393 aa7.68□□□□□ -1.18
DDI1YER143W RSC58Q07979 502 aa7.68□□□□□ -1.18
DDI1YER143W SRL2Q12020 392 aa7.68□□□□□ -1.18
DDI1YER143W RAD52P06778 471 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W URA6P15700 204 aa7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W CDC23P16522 626 aa7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W GRX2P17695 143 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W SEN34P39707 275 aa7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W MOB2P43563 287 aa7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YJL016WP47072 561 aa7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W ACS2P52910 683 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YIP5P53108 310 aa7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W TYW3P53177 273 aa7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YLR283WQ05867 314 aa7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W FIT3Q08907 204 aa7.67□□□□□ -1.18
DDI1YER143W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W MAK32P23060 363 aa7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W RPI1P23250 407 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W VMA5P31412 392 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YND1P40009 630 aa7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W OST1P41543 476 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YFL051CP43552 160 aa7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W AVT4P50944 713 aa7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W ALG12P53730 551 aa7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W HAS1Q03532 505 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W SPR28Q04921 423 aa7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YLR031WQ07978 186 aa7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data7.66□□□□□ -1.18not detected
DDI1YER143W PRS5Q12265 496 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
DDI1YER143W TDH2P00358 332 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W CDC28P00546 298 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W AAC1P04710 309 aa7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W RNA14P25298 677 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W DEG1P31115 442 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W FMT1P32785 401 aa7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W REC114P32841 428 aa7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W VAM7P32912 316 aa7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W YHL037CP38733 133 aa7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W GPI16P38875 610 aa7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W SIP18P50263 79 aa7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W USB1Q12208 290 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W HUT1Q12520 339 aa7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 106.3 ms