RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636652.1

CHRNA4-216, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 195 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-216ENST00000636652 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 FNBP1Q96RU3 617 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RNF39Q9H2S5 420 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RSAD1Q9HA92 442 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CNTN3Q9P232 1028 aa14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SCN5AQ14524 2016 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 LACTBL1A8MY62 500 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 INPPL1O15357 1258 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 HOXA2O43364 376 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 STX10O60499 249 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 AMHP03971 560 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TPM2P07951 284 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 KCNE1P15382 129 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RGS19P49795 217 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 EPHB4P54760 987 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CLDN10P78369 228 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 KRT31Q15323 416 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM240Q5SV17 173 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ZNF365Q70YC5 407 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 WDR49Q8IV35 697 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RNF169Q8NCN4 708 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 LPPQ93052 612 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SLC35C1Q96A29 364 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 FAM212AQ96EL1 285 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 CGRRF1Q99675 332 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 DERAQ9Y315 318 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 C2CD2Q9Y426 696 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 FSD2A1L4K1 749 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TRIM49P0CI25 452 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TRIM49CP0CI26 452 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GTF2H1P32780 548 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 MLH1P40692 756 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 KCNJ6P48051 423 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 AP3M2P53677 418 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 WNT7BP56706 349 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 HERVK_113Q902F9 699 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 GAD1Q99259 594 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 KLK14Q9P0G3 267 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.49□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ARL5CA6NH57 179 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SERPINC1P01008 464 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 NFICP08651 508 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 DLG4P78352 724 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 FANCCQ00597 558 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 VWA3BQ502W6 1294 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 JADE1Q6IE81 842 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SARM1Q6SZW1 724 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ZFP42Q96MM3 310 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 RNF19AQ9NV58 838 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 INTS13Q9NVM9 706 aa14.48□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 ZBBXA8MT70 800 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 LGALS16A8MUM7 142 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PTGESO14684 152 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 PMM2O15305 246 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CHRNA4-216ENST00000636652 OFD1O75665 1012 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms