RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PRG0 241 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CLRN2A0PK11 232 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 MYMKA6NI61 221 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TXNDC9O14530 226 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 MAPK13O15264 365 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 GYS1P13807 737 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ADARP55265 1226 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PTENP60484 403 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PRKG1Q13976 671 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TMED2Q15363 201 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 NEK8Q86SG6 692 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 VPS52Q8N1B4 723 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SEC14L1Q92503 715 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ALG3Q92685 438 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 BARHL2Q9NY43 387 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CHD4Q14839 1912 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PDLIM1O00151 329 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TNNI2P48788 182 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 HPCAP84074 193 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 MAPK7Q13164 816 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 GRM4Q14833 912 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 C12orf60Q5U649 245 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC55Q6ZSA7 311 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM50Q86XT4 487 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 C4orf33Q8N1A6 199 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PIGSQ96S52 555 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 EBF3Q9H4W6 596 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 POLLQ9UGP5 575 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 BRWD3Q6RI45 1802 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 POTEMA6NI47 508 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PEX10O60683 326 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PIAS1O75925 651 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 FGRP09769 529 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 GNA11P29992 359 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 GJA8P48165 433 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 OCRLQ01968 901 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ACAP1Q15027 740 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35B4Q969S0 331 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 EYA3Q99504 573 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 MYH3P11055 1940 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0G2JND7 137 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ZBED4O75132 1171 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 H2AFZP0C0S5 128 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PTPN4P29074 926 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 MAP7Q14244 749 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CALCRLQ16602 461 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 USH1GQ495M9 461 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 H2AFVQ71UI9 128 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC125Q86Z20 511 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 KRT35Q92764 455 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CORO1BQ9BR76 489 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 USP40Q9NVE5 1235 aa8.71□□□□□ -1.01
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