RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 WWP1Q9H0M0 922 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 RGL1Q9NZL6 768 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TEKT2Q9UIF3 430 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF229Q9UJW7 825 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 LCP1P13796 627 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 IFNA8P32881 189 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TTC39CQ8N584 583 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TTLL4Q14679 1199 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 GANCQ8TET4 914 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 AFG1LQ8WV93 481 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 DAB1O75553 588 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 PGM1P36871 562 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 TRPC1P48995 793 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 P3H1Q32P28 736 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 PRAMEP78395 509 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 LONRF1Q17RB8 773 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 STK33Q9BYT3 514 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 GLI2P10070 1586 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 KRT4P19013 534 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA33Q96N06 139 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 EHD2Q9NZN4 543 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 DFFAO00273 331 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 ENO1P06733 434 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 HIC1Q14526 733 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 C12orf60Q5U649 245 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 EGFL8Q99944 293 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SUPT3HO75486 399 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 SENP1Q9P0U3 644 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRM-211ENST00000580170 KCNN4O15554 427 aa22.52■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.52■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 DACH2Q96NX9 599 aa22.52■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ATP9BO43861 1147 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA17Q96L03 361 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ABCC3O15438 1527 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 GFAPP14136 432 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 RXRBP28702 533 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 GALCP54803 685 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 KIF12Q96FN5 646 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.191e-6■■□□□ 13.9
PTPRM-211ENST00000580170 PID1Q7Z2X4 250 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 POLIQ9UNA4 740 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 CLTCL1P53675 1640 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 RHOBTB3O94955 611 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 COG4Q9H9E3 785 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TMCC1O94876 653 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 KDSRQ06136 332 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 KLC1Q07866 573 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 MAPRE2Q15555 327 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TEX9Q8N6V9 391 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ACAD9Q9H845 621 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 APOA1P02647 267 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 56.2
PTPRM-211ENST00000580170 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 SIK2Q9H0K1 926 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 CEP55Q53EZ4 464 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 FOXP2O15409 715 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 SPP2Q13103 211 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 MMP19Q99542 508 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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