RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577001.1

PRPF8-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, human

TSL 5

Gene PRPF8, Length 3,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPF8-216	ENST00000577001	CIITA	P33076	1130 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	MTMR3	Q13615	1198 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	VCPKMT	Q9H867	229 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	TBX3	O15119	743 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	RIPK2	O43353	540 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	TAS2R40	P59535	323 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	MAP2K2	P36507	400 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC20A2	Q08357	652 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	IDI2	Q9BXS1	227 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	CARD9	Q9H257	536 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001		H0Y3Z8	333 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	BRAF	P15056	766 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	ADRA2B	P18089	450 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	CAP2	P40123	477 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	ANO5	Q75V66	913 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM228A	Q86W67	206 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	FUK	Q8N0W3	1084 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	NT5C1B	Q96P26	610 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	TMX2	Q9Y320	296 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	GJB1	P08034	283 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	SPDYE6	P0CI01	402 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	RWDD2B	P57060	319 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	CD302	Q8IX05	232 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	LAMA3	Q16787	3333 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	MYO1E	Q12965	1108 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	PPP2R5C	Q13362	524 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	HOOK3	Q86VS8	718 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	NETO2	Q8NC67	525 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	TMEM237	Q96Q45	408 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	FNBP1	Q96RU3	617 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	DMAC2	Q9NW81	257 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	RAB20	Q9NX57	234 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	RTN2	O75298	545 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	PPFIA2	O75334	1257 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	PLS3	P13797	630 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	PEX5	P50542	639 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	WDR78	Q5VTH9	848 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	ZWILCH	Q9H900	591 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF862	O60290	1169 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	WEE2	P0C1S8	567 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	DNAJC3	Q13217	504 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	CCDC63	Q8NA47	563 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	TBX20	Q9UMR3	447 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	PTPRJ	Q12913	1337 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	CCDC172	P0C7W6	258 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	STX2	P32856	288 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	OVGP1	Q12889	678 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	CNPY4	Q8N129	248 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF516	Q92618	1163 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PRPF8-216	ENST00000577001	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		15.8	■□□□□ 0.12

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