RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	TRIM24	O15164	1050 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PJA2	O43164	708 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	AMY1A	P04745	511 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	FPR1	P21462	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	C5AR1	P21730	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PTPN7	P35236	360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	GDF5	P43026	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	KRT85	P78386	507 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SP140	Q13342	867 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	DPF2	Q92785	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PRDM2	Q13029	1718 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	TNKS	O95271	1327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ZNF185	O15231	689 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SUV39H1	O43463	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	NDUFS2	O75306	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	KRT4	P19013	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	EDNRB	P24530	442 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PCSK1	P29120	753 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ITK	Q08881	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ODF1	Q14990	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	LENG9	Q96B70	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	GRIN2B	Q13224	1484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	WIZ	O95785	1651 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ENDOD1	O94919	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	MYBL2	P10244	700 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	CLRN1	P58418	232 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	NHLH2	Q02577	135 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	MTM1	Q13496	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	IPP	Q9Y573	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	WDR97	A6NE52	1622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COX11-208	ENST00000576084	MCM7	P33993	719 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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