RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	VWA8	A3KMH1	1905 aa		23.88	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	23.87	■■□□□ 1.41	6e-6	■■■■■ 103.4
PPP4C-205	ENST00000563200	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR33	A8MZF0	331 aa		23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	C1R	P00736	705 aa		23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MTHFR	P42898	656 aa		23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	NCKAP1L	P55160	1127 aa		23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	RTP2	Q5QGT7	225 aa		23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	HASPIN	Q8TF76	798 aa		23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	FNIP2	Q9P278	1114 aa		23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO10	Q9HD67	2058 aa		23.87	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	STX6	O43752	255 aa		23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TOM1L1	O75674	476 aa		23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	STRN3	Q13033	797 aa		23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MCM6	Q14566	821 aa		23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SPECC1	Q5M775	1068 aa		23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ZPBP2	Q6X784	338 aa		23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR149	Q86SP6	731 aa		23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB33	Q86T24	672 aa		23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	23.86	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		23.85	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	OSTN	P61366	133 aa		23.85	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	23.85	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		23.85	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	23.85	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TCHP	Q9BT92	498 aa		23.85	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		23.85	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	23.85	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		23.85	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PAPLN	O95428	1278 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	GLUD1	P00367	558 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	DDIT3	P35638	169 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	UPP1	Q16831	310 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	EDA	Q92838	391 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX27	Q96L92	541 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CLIC6	Q96NY7	704 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ACAP3	Q96P50	834 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	USP28	Q96RU2	1077 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	FIZ1	Q96SL8	496 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	NR2E1	Q9Y466	385 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200		H0YCG3	227 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNE1	P15382	129 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CLCNKB	P51801	687 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MCL1	Q07820	350 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	LILRA6	Q6PI73	481 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	UROC1	Q96N76	676 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	PARVG	Q9HBI0	331 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTN3	Q9P232	1028 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		23.84	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		23.83	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		23.83	■■□□□ 1.41
PPP4C-205	ENST00000563200	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	TGM5	O43548	720 aa		23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	SCP2	P22307	547 aa		23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CREM	Q03060	361 aa		23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC39A14	Q15043	492 aa		23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		23.83	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	PALB2	Q86YC2	1186 aa		23.82	■■□□□ 1.4
PPP4C-205	ENST00000563200	MYCT1	Q8N699	235 aa		23.82	■■□□□ 1.4

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