RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 SPATA31D3P0C874 917 aa26.8■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 MCF2P10911 925 aa26.8■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 RPL17P18621 184 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 PTPN21Q16825 1174 aa26.8■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 TRIM67Q6ZTA4 783 aa26.8■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa26.8■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC149Q6ZUS6 474 aa26.8■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 TTPALQ9BTX7 342 aa26.8■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 PTPRHQ9HD43 1115 aa26.8■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 TRIP11Q15643 1979 aa26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 H0YCG3 227 aa26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 GRIN1Q05586 938 aa26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 KARSQ15046 597 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 NAB2Q15742 525 aa26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 RTP2Q5QGT7 225 aa26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 HFE2Q6ZVN8 426 aa26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 GPR65Q8IYL9 337 aa26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 BICD1Q96G01 975 aa26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 ACAP3Q96P50 834 aa26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 FNIP2Q9P278 1114 aa26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 ODF2LQ9ULJ1 636 aa26.79■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM221A6NGB7 291 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 M0R296 226 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 B3GAT3O94766 335 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 FAM13AO94988 1023 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 PLCG1P19174 1290 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 SYT1P21579 422 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 FEZF2Q8TBJ5 459 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 FAM122AQ96E09 287 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 MFSD14AQ96MC6 490 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 UROC1Q96N76 676 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 ZHX3Q9H4I2 956 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 CLIC4Q9Y696 253 aa26.78■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 C2orf16Q68DN1 1984 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 TGM5O43548 720 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 TOM1L1O75674 476 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 MAPTP10636 758 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 CLCNKBP51801 687 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 MCM6Q14566 821 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 PSMD5Q16401 504 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 ARSHQ5FYA8 562 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 PLCD3Q8N3E9 789 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 REEP2Q9BRK0 252 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 PIDD1Q9HB75 910 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 SLC38A7Q9NVC3 462 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 USTQ9Y2C2 406 aa26.77■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 DENND4AQ7Z401 1863 aa26.76■■□□□ 1.88
PRKCH-216ENST00000555542 PROZP22891 400 aa26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 SIGLEC14Q08ET2 396 aa26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 PDXDC1Q6P996 788 aa26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 MYCT1Q8N699 235 aa26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 KREMEN2Q8NCW0 462 aa26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 RAD54LQ92698 747 aa26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 PBXIP1Q96AQ6 731 aa26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 CITO14578 2027 aa26.76■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 K7ENM7 598 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 CLDN3O15551 220 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 RFPL2O75678 378 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 RESTQ13127 1097 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 MTMR3Q13615 1198 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 ZPBP2Q6X784 338 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 OTOP3Q7RTS5 596 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 HDAC7Q8WUI4 952 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 PIK3R5Q8WYR1 880 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 SNX27Q96L92 541 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 LIMD1Q9UGP4 676 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 SORCS3Q9UPU3 1222 aa26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa26.74■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 TRAPPC3O43617 180 aa26.74■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 BRD1O95696 1058 aa26.74■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 TXLNAP40222 546 aa26.74■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 NCKAP1LP55160 1127 aa26.74■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 UPP1Q16831 310 aa26.74■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 SPECC1Q5M775 1068 aa26.74■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.74■■□□□ 1.87
PRKCH-216ENST00000555542 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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