RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 GGT7Q9UJ14 662 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ACADSP16219 412 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CHKAP35790 457 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ABL2P42684 1182 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SLC1A1P43005 524 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 PRELPP51888 382 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ITGA8P53708 1063 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.612e-6■■■□□ 17.3
CS-202ENST00000542324 RASA2Q15283 850 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SYDE2Q5VT97 1194 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 VSIG1Q86XK7 387 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ATL2Q8NHH9 583 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 GDAP1Q8TB36 358 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SLC5A5Q92911 643 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ZNF653Q96CK0 615 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 UIMC1Q96RL1 719 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 DCLK3Q9C098 648 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 TLE6Q9H808 572 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 RGL1Q9NZL6 768 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SLX4Q8IY92 1834 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SFI1A8K8P3 1242 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 NDC80O14777 642 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 PSMD10O75832 226 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SLITRK3O94933 977 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 NPTXRO95502 500 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ASMTLO95671 621 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 DLATP10515 647 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ZNF76P36508 570 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 MFAP3P55082 362 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 FMO1Q01740 532 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 MOGSQ13724 837 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SPARCL1Q14515 664 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 RASA3Q14644 834 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ODR4Q5SWX8 454 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 OTOP1Q7RTM1 612 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SYCP3Q8IZU3 236 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CCDC89Q8N998 374 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SHC3Q92529 594 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 MAML1Q92585 1016 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 GMCL1Q96IK5 515 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 DYDC2Q96IM9 177 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 TTC25Q96NG3 672 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 WDR11Q9BZH6 1224 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 MYLK2Q9H1R3 596 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SAR1AQ9NR31 198 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 BTAF1O14981 1849 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CLDN3O15551 220 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 KCNQ2O43526 872 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SGPL1O95470 568 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 GH1P01241 217 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 LINGO3P0C6S8 592 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 TPBGLP0DKB5 382 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 FOXN2P32314 431 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CDR2Q01850 454 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 KYNUQ16719 465 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CRY2Q49AN0 593 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CNBD1Q8NA66 436 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 TRIM11Q96F44 468 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CFAP57Q96MR6 1250 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 BCAS3Q9H6U6 928 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 ATRNL1Q5VV63 1379 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 LRRD1A4D1F6 860 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 GNPATO15228 680 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-202ENST00000542324 EDF1O60869 148 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms