RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528935.1

PACS1-207, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-207ENST00000528935 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 POMKQ9H5K3 350 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 CASTOR2A6NHX0 329 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 C1RP00736 705 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 WEE2P0C1S8 567 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 GRM5P41594 1212 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 ZNF568Q3ZCX4 644 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 TMC5Q6UXY8 1006 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 GPR149Q86SP6 731 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 B3GALT6Q96L58 329 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 SPATA32Q96LK8 384 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 CDT1Q9H211 546 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 DPP7Q9UHL4 492 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-207ENST00000528935 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 KIF4AO95239 1232 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 MCF2P10911 925 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 PROZP22891 400 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 CREMQ03060 361 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa15.95■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 TCHPQ9BT92 498 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 FNIP2Q9P278 1114 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.95■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 ABLIM1O14639 778 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 MAPTP10636 758 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 SP100P23497 879 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 RESTQ13127 1097 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 XKR4Q5GH76 650 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 GLRA4Q5JXX5 417 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 MPZL3Q6UWV2 235 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 ALKAL1Q6UXT8 129 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa15.94■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 ZBTB33Q86T24 672 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 CEP120Q8N960 986 aa15.94■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 MAN1C1Q9NR34 630 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 CLIC4Q9Y696 253 aa15.94■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 C2CD4DB7Z1M9 353 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 H0YCG3 227 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 TOM1L1O75674 476 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 PLCG1P19174 1290 aa15.93■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 OSTNP61366 133 aa15.93■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 PTPAQ15257 358 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 PTPN21Q16825 1174 aa15.93■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 FAM171A1Q5VUB5 890 aa15.93■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 CYP26C1Q6V0L0 522 aa15.93■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 PALB2Q86YC2 1186 aa15.93■□□□□ 0.14
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PACS1-207ENST00000528935 RAD54LQ92698 747 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 UROC1Q96N76 676 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 ACAP3Q96P50 834 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 REEP2Q9BRK0 252 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 TTPALQ9BTX7 342 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 CCSER1Q9C0I3 900 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 USTQ9Y2C2 406 aa15.93■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 TGM5O43548 720 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 SPATA31D3P0C874 917 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 SCP2P22307 547 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 CLCNKBP51801 687 aa15.92■□□□□ 0.14
PACS1-207ENST00000528935 NCKAP1LP55160 1127 aa15.92■□□□□ 0.14
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