RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524035.5

MEG3-222, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 2,853 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-222	ENST00000524035	TGFB3	P10600	412 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	GZMA	P12544	262 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	COPB2	P35606	906 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	PIK3CA	P42336	1068 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ERVK-9	P63128	1117 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	PPIL2	Q13356	520 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	KRT35	Q92764	455 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	MMP19	Q99542	508 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	AMACR	Q9UHK6	382 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		18.43	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ABCD1	P33897	745 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	CLDN10	P78369	228 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	PAK2	Q13177	524 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ZACN	Q401N2	412 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	CAVIN3	Q969G5	261 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF653	Q96CK0	615 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	GPR20	Q99678	358 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	SYT17	Q9BSW7	474 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	CLSTN1	O94985	981 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	PIGR	P01833	764 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	EPHX2	P34913	555 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	GCNT1	Q02742	428 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	KCTD2	Q14681	263 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ZBTB33	Q86T24	672 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	NUP85	Q9BW27	656 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		18.42	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035		A0A0B4J269	797 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ADCY3	O60266	1144 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	GRIN3B	O60391	1043 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	GJA5	P36382	358 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	COMT	P21964	271 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	WDR44	Q5JSH3	913 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		18.41	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	TNFSF9	P41273	254 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	LMAN1	P49257	510 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	CCDC188	H7C350	402 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	GJB1	P08034	283 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	CYP2C8	P10632	490 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	OSBP	P22059	807 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	SPATA33	Q96N06	139 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	CARD9	Q9H257	536 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	TRPC6	Q9Y210	931 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	TTI1	O43156	1089 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	ENPEP	Q07075	957 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	C2CD6	Q53TS8	623 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	EXOC4	Q96A65	974 aa		18.4	■□□□□ 0.54
MEG3-222	ENST00000524035	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	CYP1A2	P05177	515 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	TCEAL1	Q15170	157 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	TCHP	Q9BT92	498 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	EFCC1	Q9HA90	598 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	CLDN3	O15551	220 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	RNF149	Q8NC42	400 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
MEG3-222	ENST00000524035	CFH	P08603	1231 aa		18.38	■□□□□ 0.53

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