RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521262.5

RPS20-208, Transcript of ribosomal protein S20, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPS20, Length 650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS20-208	ENST00000521262	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	STX10	O60499	249 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	RECQL4	O94761	1208 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	CLDN10	P78369	228 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	MAN2A1	Q16706	1144 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	DERA	Q9Y315	318 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21	2e-16	■□□□□ 8.6
RPS20-208	ENST00000521262	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	HOXA2	O43364	376 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	SERPINC1	P01008	464 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	AMH	P03971	560 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	TNNI1	P19237	187 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	GTF2H1	P32780	548 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	RGS19	P49795	217 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	AP3M2	P53677	418 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	GSE1	Q14687	1217 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	KRT31	Q15323	416 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	TMEM240	Q5SV17	173 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21	6e-8	■■□□□ 13.7
RPS20-208	ENST00000521262	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	SNX27	Q96L92	541 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS20-208	ENST00000521262	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	OFD1	O75665	1012 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	KCNE1	P15382	129 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	DLG4	P78352	724 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	FANCC	Q00597	558 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	LPP	Q93052	612 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	GAD1	Q99259	594 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	VPS16	Q9H269	839 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	INPPL1	O15357	1258 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	MLH1	P40692	756 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	KCNJ6	P48051	423 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	EPHB4	P54760	987 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	WNT7B	P56706	349 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	UBASH3A	P57075	661 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	ABI1	Q8IZP0	508 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22	1e-16	■■■■□ 20.3
RPS20-208	ENST00000521262	NDST4	Q9H3R1	872 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS20-208	ENST00000521262	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22

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