RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSTN	P61366	133 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCL1	Q07820	350 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNX27	Q96L92	541 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	TECTA	O75443	2155 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCX	O43602	365 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM189A1	O60320	539 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR37L1	O60883	481 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR1I2	O75469	434 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	TADA2A	O75478	443 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAPLN	O95428	1278 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLRC2	P26717	231 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLCNKB	P51801	687 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMTN	P53814	917 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITIH3	Q06033	890 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	PKP1	Q13835	747 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	UPP1	Q16831	310 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEZ6	Q53EL9	994 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	PARVG	Q9HBI0	331 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYMK	A6NI61	221 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM13A	O94988	1023 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIGR	P01833	764 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNE1	P15382	129 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	STRN3	Q13033	797 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYCT1	Q8N699	235 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACAP3	Q96P50	834 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	STK17A	Q9UEE5	414 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBX20	Q9UMR3	447 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAM12	O43184	909 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAK2	O60296	914 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R37	O75864	691 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTF2B	Q00403	316 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TISP43	B9A030	160 aa		13.89	□□□□□ -0.19

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