RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504047.1

ATXN3-208, Transcript of ataxin 3, human

TSL 3

Gene ATXN3, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-208	ENST00000504047	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	DPF2	Q92785	391 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF202	O95125	648 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	FSHB	P01225	129 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ADH4	P08319	380 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ALAS1	P13196	640 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	DDC	P20711	480 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC6A9	P48067	706 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	MXRA7	P84157	204 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	DGCR2	P98153	550 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	NHLH2	Q02577	135 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	HAS1	Q92839	578 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	CYR61	O00622	381 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SGTA	O43765	313 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	DTNB	O60941	627 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	VCAM1	P19320	739 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	NEK2	P51955	445 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	MTM1	Q13496	603 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	COA7	Q96BR5	231 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	LEFTY2	O00292	366 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	IL33	O95760	270 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	LAG3	P18627	525 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	FPR1	P21462	350 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	PCSK1	P29120	753 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	CHN2	P52757	468 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	RAB39A	Q14964	217 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	MED25	Q71SY5	747 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76

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