RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAMP2O60895 175 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PEX11BO96011 259 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PROZP22891 400 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADRA1BP35368 520 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DPF2Q92785 391 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDC1Q9BTX1 674 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTPALQ9BTX7 342 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LDAHQ9H6V9 325 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR26Q9H7D7 661 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNM3Q9UQ16 869 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PJA2O43164 708 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFS2O75306 463 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ENDOD1O94919 500 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SP140Q13342 867 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ODF1Q14990 250 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACAP2Q15057 778 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STON2Q8WXE9 905 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.13□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AHRRA9YTQ3 701 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LEFTY2O00292 366 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM20BO75063 409 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPFIA2O75334 1257 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AMY1AP04745 511 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PER3P56645 1201 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPN21Q16825 1174 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AFMIDQ63HM1 303 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METRNLQ641Q3 311 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TFAP2CQ92754 450 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEKT5Q96M29 485 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPON1Q9HCB6 807 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LANCL2Q9NS86 450 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM24O15164 1050 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL2RBP14784 551 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FPR1P21462 350 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR4A1P22736 598 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCSK1P29120 753 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLRN1P58418 232 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF169Q8NCN4 708 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INTUQ9ULD6 942 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IPPQ9Y573 584 aa6.11□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EDNRBP24530 442 aa6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP8B2P98198 1209 aa6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRI1Q9BV20 369 aa6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.1□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BMP5P22003 454 aa6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALDH1A3P47895 512 aa6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NHLH2Q02577 135 aa6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTM1Q13496 603 aa6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF276Q8N554 614 aa6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR150Q8NGU9 434 aa6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COA7Q96BR5 231 aa6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEU1Q99519 415 aa6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms