RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPECC1	Q5M775	1068 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHC4	Q6S5L8	630 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	NSMF	Q6X4W1	530 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEK8	Q86SG6	692 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRR13	Q9NZ81	148 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PP2D1	A8MPX8	630 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRR33	A8MZF0	331 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR64	B1ANS9	1081 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPTLC2	O15270	562 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	YEATS4	O95619	227 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	AR	P10275	920 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	XBP1	P17861	261 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	EDNRB	P24530	442 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC25A	P30304	524 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRT85	P78386	507 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	LETM2	Q2VYF4	491 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TKFC	Q3LXA3	575 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MB21D1	Q8N884	522 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHST13	Q8NET6	341 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP6NL	Q92738	828 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACAD9	Q9H845	621 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PXMP2	Q9NR77	195 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GJD2	Q9UKL4	321 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEIS1	O00470	390 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MSH4	O15457	936 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CA12	O43570	354 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUSD5	O60279	629 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TLR2	O60603	784 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP9A	O75110	1047 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRN2	O75325	713 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBC1D8	O95759	1140 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRF	P11831	508 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAPPC10	P48553	1259 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SP2	Q02086	613 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNK2	Q07912	1038 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PGM5	Q15124	567 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATL3	Q6DD88	541 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR142	Q7Z601	462 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	BICD2	Q8TD16	824 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MORC4	Q8TE76	937 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPSTI1	Q96J88	318 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	KATNBL1	Q9H079	304 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSRNP2	Q9H175	543 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPN3	Q9H201	632 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF186	Q9NXI6	227 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	HPSE	Q9Y251	543 aa		6.93	□□□□□ -1.3
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms