RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TOM1L1O75674 476 aa17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TXLNAP40222 546 aa17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 YARSP54577 528 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STK38Q15208 465 aa17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP41Q3LFD5 358 aa17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RRAGBQ5VZM2 374 aa17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIAA1841Q6NSI8 718 aa17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZPBP2Q6X784 338 aa17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HAUS6Q7Z4H7 955 aa17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZHX3Q9H4I2 956 aa17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STK17AQ9UEE5 414 aa17.05■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LOC730098B7Z3J9 87 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 K7ENM7 598 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TEX28O15482 410 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBCAO75347 108 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ITIH3Q06033 890 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 XKR4Q5GH76 650 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CES5AQ6NT32 575 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KANK3Q6NY19 840 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALKAL1Q6UXT8 129 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LINC00301Q8NCQ3 95 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNN1Q92952 543 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BICD1Q96G01 975 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNX27Q96L92 541 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXL18Q96ME1 805 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACAP3Q96P50 834 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADAM7Q9H2U9 754 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RXFP1Q9HBX9 757 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIP11Q15643 1979 aa17.04■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLDN3O15551 220 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRAK2O60296 914 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADH1AP07327 375 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WEE2P0C1S8 567 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MCL1Q07820 350 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEZ6Q53EL9 994 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RTP2Q5QGT7 225 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FIZ1Q96SL8 496 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HAPLN2Q9GZV7 340 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBX20Q9UMR3 447 aa17.03■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLXNA3P51805 1871 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A087X0B3 334 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPDYE4A6NLX3 237 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DCXO43602 365 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALADP13716 330 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCP2P22307 547 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLCNKBP51801 687 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM171A1Q5VUB5 890 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DYMQ7RTS9 669 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF135Q8IUD6 432 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR65Q8IYL9 337 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FEZF2Q8TBJ5 459 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UROC1Q96N76 676 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PANK2Q9BZ23 570 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POMKQ9H5K3 350 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SFXN1Q9H9B4 322 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAN1C1Q9NR34 630 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNTN3Q9P232 1028 aa17.02■□□□□ 0.32
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CITO14578 2027 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM86C2PA6NEL3 165 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYMKA6NI61 221 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPTLC2O15270 562 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 B3GAT3O94766 335 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GLUD1P00367 558 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 F13A1P00488 732 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIGRP01833 764 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNE1P15382 129 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPL17P18621 184 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SP100P23497 879 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NMT1P30419 496 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STAT6P42226 847 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MTHFRP42898 656 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LIG4P49917 911 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PKP1Q13835 747 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UPP1Q16831 310 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC10A6Q3KNW5 377 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms