RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 SNX3O60493 162 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ETS1P14921 441 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 CHRNB2P17787 502 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 TARSP26639 723 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 GSCP56915 257 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 PLCB4Q15147 1175 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 PGM2Q96G03 612 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM213AQ9BRX8 229 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNH7Q9NS40 1196 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 PARP2Q9UGN5 583 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 NUDT17P0C025 328 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 RARGP13631 454 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC8A1P32418 973 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 EMC10Q5UCC4 262 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 SPATA21Q7Z572 469 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ERICH1Q86X53 443 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 SP8Q8IXZ3 490 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 C5orf60A6NFR6 353 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ECE2O60344 883 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 CETPP11597 493 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 FMO1Q01740 532 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 XRCC4Q13426 336 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 CYFIP1Q7L576 1253 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 PITPNM3Q9BZ71 974 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 KLHL14Q9P2G3 628 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 LDHDQ86WU2 507 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 FITM2Q8N6M3 262 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ACCSQ96QU6 501 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ITGB5P18084 799 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 FOXR2Q6PJQ5 311 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 RFX8Q6ZV50 586 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ANKMY2Q8IV38 441 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 NT5C1BQ96P26 610 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 PAGR1Q9BTK6 254 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 TUFT1Q9NNX1 390 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 SAYSD1Q9NPB0 183 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 DCTN4Q9UJW0 460 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF148Q9UQR1 794 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 SBF2Q86WG5 1849 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 DENND3A2RUS2 1198 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 GAS8O95995 478 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 MMP10P09238 476 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 PEX5P50542 639 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 MFAP3P55082 362 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 KIF22Q14807 665 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 RPAINQ86UA6 219 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 CRAMP1Q96RY5 1269 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 NENFQ9UMX5 172 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 CFHP08603 1231 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 PAEPP09466 180 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 NQO1P15559 274 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 NCALDP61601 193 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 PPP2R5EQ16537 467 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 UGCGQ16739 394 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 CRYGNQ8WXF5 182 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ERP27Q96DN0 273 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 TXLNGYQ9BZA5 131 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 WNT8AQ9H1J5 351 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1B0GUA9 196 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 LMO3Q8TAP4 145 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 MKL1Q969V6 931 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 MBOAT7Q96N66 472 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 HAO1Q9UJM8 370 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 PLIN4Q96Q06 1357 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ACOT2P49753 483 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 IZUMO3Q5VZ72 239 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 KRT27Q7Z3Y8 459 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 SEC14L1Q92503 715 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 MKNK1Q9BUB5 465 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 TMOD2Q9NZR1 351 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 YWHABP31946 246 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 P3H1Q32P28 736 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 HHIPL2Q6UWX4 724 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 RUNDC3BQ96NL0 473 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 FRMPD4Q14CM0 1322 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 PDHA1P08559 390 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 OVGP1Q12889 678 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 MOXD1Q6UVY6 613 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRJ-202ENST00000440289 VSTM1Q6UX27 236 aa19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms