RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 LIN9Q5TKA1 542 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR93Q6P2C0 686 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 C7orf31Q8N865 590 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF169Q8NCN4 708 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 NR1D1P20393 614 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 RAP1GAPP47736 663 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC14Q15048 493 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 DGAT1O75907 488 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 EMBQ6PCB8 327 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 DPP9Q86TI2 863 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ALG3Q92685 438 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 GGT7Q9UJ14 662 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRD1A4D1F6 860 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP11B1P15538 503 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 DSG3P32926 999 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 CEP120Q8N960 986 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 NEK9Q8TD19 979 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 NLRP7Q8WX94 980 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 MBOAT7Q96N66 472 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFSF9P41273 254 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 DBN1Q16643 649 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 PWWP2AQ96N64 755 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 PLVAPQ9BX97 442 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 COG5Q9UP83 839 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 XKR3Q5GH77 459 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB17Q9H0T7 212 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 PIAS1O75925 651 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT10P13645 584 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 HSD17B4P51659 736 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 SP2Q02086 613 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 MTFR1LQ9H019 292 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ARL10Q8N8L6 244 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 PYGMP11217 842 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ADSSP30520 456 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 IFT88Q13099 833 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 CDHR1Q96JP9 859 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 MYH4Q9Y623 1939 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 PJA2O43164 708 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 CA8P35219 290 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 AMHR2Q16671 573 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 C4orf19Q8IY42 314 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 SCN9AQ15858 1988 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM253P0C7T8 217 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms