RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 KIF4AO95239 1232 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 PIGRP01833 764 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 THP07101 528 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 TNFSF9P41273 254 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 TUSC3Q13454 348 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 AAK1Q2M2I8 961 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 MAP4K3Q8IVH8 894 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 HASPINQ8TF76 798 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 SNX27Q96L92 541 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 TCHPQ9BT92 498 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CFAP45Q9UL16 551 aa11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 H0YCG3 227 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 NCK2O43639 380 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 SOD2P04179 222 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 MYBP10242 640 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CA8P35219 290 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFV1P49821 464 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CLCNKBP51801 687 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 SPAG1Q07617 926 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 BECN1Q14457 450 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA0319Q5VV43 1072 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 FUT10Q6P4F1 479 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 SYCE2Q6PIF2 218 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 C3orf58Q8NDZ4 430 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 BICD1Q96G01 975 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 ACAP3Q96P50 834 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 TRIM9Q9C026 710 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 TNMDQ9H2S6 317 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CD320Q9NPF0 282 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CHST7Q9NS84 486 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CDH22Q9UJ99 828 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 IRAK3Q9Y616 596 aa11.75□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 TRIP11Q15643 1979 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0B4J269 797 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GVL5 298 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 C2CD2LO14523 706 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CLDN3O15551 220 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 MBTPS2O43462 519 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CNPP09543 421 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CXCL8P10145 99 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 IDEP14735 1019 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 EPCAMP16422 314 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 ADSSP30520 456 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 LIG4P49917 911 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 KRT85P78386 507 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 COASYQ13057 564 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 KANK3Q6NY19 840 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 KLHL5Q96PQ7 755 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 COLEC11Q9BWP8 271 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 APOL5Q9BWW9 433 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 S1PR5Q9H228 398 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 PANK4Q9NVE7 773 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CNTN3Q9P232 1028 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CD207Q9UJ71 328 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 ADAM28Q9UKQ2 775 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 HPSEQ9Y251 543 aa11.74□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CARNS1A5YM72 827 aa11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 TADA2AO75478 443 aa11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 GCNT3O95395 438 aa11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 KCNE1P15382 129 aa11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 PFKFB1P16118 471 aa11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 GAP43P17677 238 aa11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 DSG1Q02413 1049 aa11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 CUL4BQ13620 913 aa11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 UPP1Q16831 310 aa11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 RTP2Q5QGT7 225 aa11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 ANKRD54Q6NXT1 300 aa11.73□□□□□ -0.53
ATG4B-210ENST00000428861 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms