RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360564.5

MMP17-201, Transcript of matrix metallopeptidase 17, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP17, Length 2,411 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17-201ENST00000360564 CAGE1Q8TC20 777 aa22.38■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.38■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 ZNF516Q92618 1163 aa22.38■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 AKT3Q9Y243 479 aa22.38■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 MAGEB2O15479 319 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 RFX1P22670 979 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 PPFIA1Q13136 1202 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 PSMD6Q15008 389 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 TLK2Q86UE8 772 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 KAT5Q92993 513 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 APBA2Q99767 749 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 ASAP2O43150 1006 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 B4GALT5O43286 388 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 SRGAP2O75044 1071 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 TACC1O75410 805 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 VTNP04004 478 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 GTF2H1P32780 548 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 PTENP60484 403 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 GRIK4Q16099 956 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 RAB20Q9NX57 234 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.37■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 COL1A2P08123 1366 aa22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 PTPRJQ12913 1337 aa22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 A6NJR5 290 aa22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 CA12O43570 354 aa22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 IQCF3P0C7M6 154 aa22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 TNFSF9P41273 254 aa22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 FZD8Q9H461 694 aa22.36■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 A0A087WZ62 844 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 TMOD1P28289 359 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 GPC3P51654 580 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 CLDN10P78369 228 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 MED4Q9NPJ6 270 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 SETD4Q9NVD3 440 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 MGAMO43451 1857 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 ACKR2O00590 384 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 ENPEPQ07075 957 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 FAM71BQ8TC56 605 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 VPS18Q9P253 973 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.35■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 MYH10P35580 1976 aa22.34■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 FAM189A1O60320 539 aa22.34■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.34■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 NAGPAQ9UK23 515 aa22.34■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 BRCA2P51587 3418 aa22.34■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 PJA2O43164 708 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 MOCS3O95396 460 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 USP8P40818 1118 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 VPS36Q86VN1 386 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 ABLIM1O14639 778 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 PHKA2P46019 1235 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 BIRC3Q13489 604 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 IRF5Q13568 498 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 NT5C1BQ96P26 610 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 SNX12Q9UMY4 172 aa22.33■■□□□ 1.17
MMP17-201ENST00000360564 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.33■■□□□ 1.16
MMP17-201ENST00000360564 PRLRP16471 622 aa22.32■■□□□ 1.16
MMP17-201ENST00000360564 MCL1Q07820 350 aa22.32■■□□□ 1.16
MMP17-201ENST00000360564 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
MMP17-201ENST00000360564 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.32■■□□□ 1.16
MMP17-201ENST00000360564 HELQQ8TDG4 1101 aa22.32■■□□□ 1.16
MMP17-201ENST00000360564 TATDN2Q93075 761 aa22.32■■□□□ 1.16
MMP17-201ENST00000360564 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.32■■□□□ 1.16
MMP17-201ENST00000360564 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
MMP17-201ENST00000360564 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
MMP17-201ENST00000360564 CCDC172P0C7W6 258 aa22.32■■□□□ 1.16
MMP17-201ENST00000360564 PSMC4P43686 418 aa22.32■■□□□ 1.16
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