RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 GPD1LQ8N335 351 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PPP4R1Q8TF05 950 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 TATDN2Q93075 761 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 VCX3BQ9H321 246 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 NEU2Q9Y3R4 380 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 P4HA2O15460 535 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 MAGEA4P43358 317 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 MTM1Q13496 603 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 Q4G0T1 1027 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PLA2G4FQ68DD2 849 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 MAP7D3Q8IWC1 876 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KCTD17Q8N5Z5 321 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KRT35Q92764 455 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 NRBP2Q9NSY0 501 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RASSF10A6NK89 507 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 EML1O00423 815 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CLGNO14967 610 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PYGMP11217 842 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 IL1R1P14778 569 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 NQO1P15559 274 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 IRX4P78413 519 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CFAP36Q96G28 342 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 UNC45AQ9H3U1 944 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 STOML1Q9UBI4 398 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 USH1CQ9Y6N9 552 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CCND2P30279 289 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SWSAP1Q6NVH7 229 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RIPK2O43353 540 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 STK10O94804 968 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 TNFAIP1Q13829 316 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KIFC3Q9BVG8 833 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 IP6K2Q9UHH9 426 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KIF1AQ12756 1690 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ANP32DO95626 131 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ARP10275 920 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SEPT14Q6ZU15 432 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 HSPH1Q92598 858 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PCSK1NQ9UHG2 260 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SLURP2P0DP57 97 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 P4HA1P13674 534 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 POLE2P56282 527 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SMC1BQ8NDV3 1235 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PGM2Q96G03 612 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 GPRC5CQ9NQ84 441 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CPP00450 1065 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ARFIP2P53365 341 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SLFN12LQ6IEE8 588 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KCNH7Q9NS40 1196 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ASAP2O43150 1006 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 MAP3K7O43318 606 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ACOT2P49753 483 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 TMPRSS15P98073 1019 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CYTH2Q99418 400 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 NPHS2Q9NP85 383 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KCNMB3Q9NPA1 279 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 BTNL10A8MVZ5 291 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ATP6V1G2O95670 118 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 GSTA1P08263 222 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 GHRP10912 638 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 GZMAP12544 262 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CYP11B1P15538 503 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CNGA1P29973 690 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SERPINB6P35237 376 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PDE1BQ01064 536 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 TRIM42Q8IWZ5 723 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 KAT2BQ92831 832 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RIT2Q99578 217 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 TRIM4Q9C037 500 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SENP1Q9P0U3 644 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 COPEO14579 308 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 CALB1P05937 261 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 SFNP31947 248 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 HIF1AQ16665 826 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 QPCTQ16769 361 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRU-201ENST00000345512 ATP11CQ8NB49 1132 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms