RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 RGS9BPQ6ZS82 235 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 KCTD1Q719H9 257 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 ZFAND2BQ8WV99 257 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 SYT15Q9BQS2 421 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 DCLRE1BQ9H816 532 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 ASMTLO95671 621 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 EPHB2P29323 1055 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 TUBP50607 506 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 GABPAQ06546 454 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 GALNT15Q8N3T1 639 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 PARVGQ9HBI0 331 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.6■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 UPP2O95045 317 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP1A2P05177 515 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 CETN1Q12798 172 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 TRAF1Q13077 416 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 DNAJC3Q13217 504 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 IRGCQ6NXR0 463 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 LENG9Q96B70 501 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 EURLQ9NYK6 297 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 SPARCL1Q14515 664 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 TMED2Q15363 201 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 BTBD6Q96KE9 485 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 SETDB2Q96T68 719 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 STOML1Q9UBI4 398 aa21.59■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 H0Y3Z8 333 aa21.58■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 T-ENOLP0DO92 83 aa21.58■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 CHRNB2P17787 502 aa21.58■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 RXRBP28702 533 aa21.58■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 TM4SF1P30408 202 aa21.58■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 CPNE8Q86YQ8 564 aa21.58■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.58■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 VAV3Q9UKW4 847 aa21.58■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.58■■□□□ 1.05
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.58■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.58■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.58■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ADCY8P40145 1251 aa21.58■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.58■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 RELL1Q8IUW5 271 aa21.58■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGEF19Q8IW93 802 aa21.58■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 BBOF1Q8ND07 529 aa21.58■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TTC8Q8TAM2 541 aa21.58■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.58■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 MEIS2O14770 477 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 NVLO15381 856 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 EXOC3O60645 756 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 KSR1Q8IVT5 923 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF653Q96CK0 615 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TLE6Q9H808 572 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CHST7Q9NS84 486 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 GAKO14976 1311 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.043e-11■■■■■ 27
PPP1CC-201ENST00000335007 MARK3P27448 753 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 POLD1P28340 1107 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 PTPN4P29074 926 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 C10orf82Q8WW14 230 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF333Q96JL9 665 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.57■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ABHD2P08910 425 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 MUTP22033 750 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 VHLP40337 213 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 RPS6KA3P51812 740 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC18A1P54219 525 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 PDK4Q16654 411 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CEP128Q6ZU80 1094 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 MAML1Q92585 1016 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 C2CD2Q9Y426 696 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM86B1E9PN63 330 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 MSH4O15457 936 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ECE2O60344 883 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 ENTPD5O75356 428 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 TRABD2AQ86V40 505 aa21.56■■□□□ 1.04
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms