RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 OCM2P0CE71 109 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
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PTPRB-202ENST00000334414 CCT8P50990 548 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CCZ1BP86790 482 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
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PTPRB-202ENST00000334414 USH1GQ495M9 461 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRB-202ENST00000334414 USP38Q8NB14 1042 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 ERVV-2B6SEH9 535 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 P4HA2O15460 535 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 GNAT1P11488 350 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 PLCG1P19174 1290 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 TNFRSF8P28908 595 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-202ENST00000334414 IRAK1P51617 712 aa5.8□□□□□ -1.48
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