RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM8AQ9HCN3 771 aa29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 MXI1P50539 228 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 AP3M2P53677 418 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP3CAQ08209 521 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYCP1Q15431 976 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPN21Q16825 1174 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf220Q5T0J3 134 aa29.71■■■□□ 2.35
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CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR49Q8IV35 697 aa29.71■■■□□ 2.35
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAIPQ9BWF2 469 aa29.71■■■□□ 2.35
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MGEA5O60502 916 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLDN10P78369 228 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC10A6Q3KNW5 377 aa29.71■■■□□ 2.35
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGA4P13612 1032 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAG1P15918 1043 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 RFC2P35250 354 aa29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOC3L4Q17RC7 722 aa29.7■■■□□ 2.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CBWD5Q5RIA9 395 aa29.7■■■□□ 2.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DBF4BQ8NFT6 615 aa29.7■■■□□ 2.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TIMP1P01033 207 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKAP5P24588 427 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 PBX1P40424 430 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNT7BP56706 349 aa29.69■■■□□ 2.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM117Q9H0C3 514 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGS18Q9NS28 235 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0U1RQF3 1178 aa29.68■■■□□ 2.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM191BP0C7N4 346 aa29.68■■■□□ 2.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf112Q9NSG2 853 aa29.68■■■□□ 2.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GPNMBQ14956 572 aa29.67■■■□□ 2.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC24A5Q71RS6 500 aa29.67■■■□□ 2.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM199Q8N511 208 aa29.66■■■□□ 2.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SIK3Q9Y2K2 1263 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 DERAQ9Y315 318 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 C2CD2Q9Y426 696 aa29.66■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNMA1Q12791 1236 aa29.65■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZACNQ401N2 412 aa29.65■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 ECHDC2Q86YB7 292 aa29.65■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXL13Q8NEE6 735 aa29.65■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5B17Q8NGF7 314 aa29.65■■■□□ 2.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 IQCDQ96DY2 449 aa29.65■■■□□ 2.34
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