RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
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CCDC71L-201ENST00000315965 AP3M2P53677 418 aa26.03■■□□□ 1.76
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CCDC71L-201ENST00000315965 CBWD5Q5RIA9 395 aa26.03■■□□□ 1.76
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CCDC71L-201ENST00000315965 PMM2O15305 246 aa26.03■■□□□ 1.76
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CCDC71L-201ENST00000315965 RFC2P35250 354 aa26.02■■□□□ 1.76
CCDC71L-201ENST00000315965 GBP6Q6ZN66 633 aa26.02■■□□□ 1.76
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CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM117Q9H0C3 514 aa26.02■■□□□ 1.76
CCDC71L-201ENST00000315965 RGS18Q9NS28 235 aa26.02■■□□□ 1.76
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CCDC71L-201ENST00000315965 AKAP5P24588 427 aa26.01■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 EXOC3L4Q17RC7 722 aa26.01■■□□□ 1.75
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CCDC71L-201ENST00000315965 DBF4BQ8NFT6 615 aa26.01■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 SNX27Q96L92 541 aa26.01■■□□□ 1.75
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CCDC71L-201ENST00000315965 TET1Q8NFU7 2136 aa26■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 TRIP11Q15643 1979 aa26■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 RAG1P15918 1043 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 KCNMA1Q12791 1236 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC24A5Q71RS6 500 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 NT5DC4Q86YG4 428 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 ABHD8Q96I13 439 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.99■■□□□ 1.75
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CCDC71L-201ENST00000315965 RNF39Q9H2S5 420 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
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CCDC71L-201ENST00000315965 JADE1Q6IE81 842 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 ALKAL1Q6UXT8 129 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 EFCAB13Q8IY85 973 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 OR5B17Q8NGF7 314 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 PGBD4Q96DM1 585 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 CNTN3Q9P232 1028 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 DERAQ9Y315 318 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 C2CD2Q9Y426 696 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 ALPK3Q96L96 1907 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 TNNC2P02585 160 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 KLK7P49862 253 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 BIRC3Q13489 604 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM132DQ14C87 1099 aa25.98■■□□□ 1.75
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