RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM189A1O60320 539 aa23.16■■□□□ 1.3
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SNRNP25-201ENST00000293861 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 USP8P40818 1118 aa23.16■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
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SNRNP25-201ENST00000293861 ACVR2BQ13705 512 aa23.16■■□□□ 1.3
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SNRNP25-201ENST00000293861 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.16■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.16■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.16■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.16■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.16■■□□□ 1.3
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SNRNP25-201ENST00000293861 CPA4Q9UI42 421 aa23.16■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.15■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
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SNRNP25-201ENST00000293861 BRSK2Q8IWQ3 736 aa23.15■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 RHOT2Q8IXI1 618 aa23.15■■□□□ 1.3
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SNRNP25-201ENST00000293861 PBKQ96KB5 322 aa23.15■■□□□ 1.3
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SNRNP25-201ENST00000293861 ABCB6Q9NP58 842 aa23.15■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
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SNRNP25-201ENST00000293861 CYP11B1P15538 503 aa23.14■■□□□ 1.3
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SNRNP25-201ENST00000293861 WDR44Q5JSH3 913 aa23.14■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa23.14■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 MORN1Q5T089 497 aa23.14■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 TAF4BQ92750 862 aa23.14■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 ARID3AQ99856 593 aa23.14■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 FZD8Q9H461 694 aa23.14■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPRJQ12913 1337 aa23.14■■□□□ 1.3
SNRNP25-201ENST00000293861 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 ABLIM1O14639 778 aa23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 SMPD1P17405 629 aa23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 CDR2Q01850 454 aa23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 POU5F1BQ06416 359 aa23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 MCL1Q07820 350 aa23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 LONRF2Q1L5Z9 754 aa23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC70Q6NSX1 233 aa23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 RGMBQ6NW40 437 aa23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC47A2Q86VL8 602 aa23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 THAP2Q9H0W7 228 aa23.14■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 VNN1O95497 513 aa23.13■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 PROZP22891 400 aa23.13■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 PDE6CP51160 858 aa23.13■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 FMO1Q01740 532 aa23.13■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP2K5Q13163 448 aa23.13■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 PEX26Q7Z412 305 aa23.13■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.13■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 METTL13Q8N6R0 699 aa23.13■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 PIK3CAP42336 1068 aa23.12■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 CLCN3P51790 818 aa23.12■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 DAAM2Q86T65 1068 aa23.12■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.12■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 OSGEPQ9NPF4 335 aa23.12■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 MMP3P08254 477 aa23.12■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 SURF1Q15526 300 aa23.12■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR49Q8IV35 697 aa23.12■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT222Q8N1A0 295 aa23.12■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.12■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 HES6Q96HZ4 224 aa23.12■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 MS4A14Q96JA4 679 aa23.12■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPRHQ9HD43 1115 aa23.12■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 EHD2Q9NZN4 543 aa23.12■■□□□ 1.29
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