RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	SPG5	P42933	373 aa		5.3	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	SER2	P42941	309 aa		5.3	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	SOL1	P50278	321 aa		5.3	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	HST3	P53687	447 aa		5.3	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	ABF2	Q02486	183 aa		5.3	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YOR114W	Q12219	294 aa		5.3	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	MHT1	Q12525	324 aa		5.3	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	ARA1	P38115	344 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YBR241C	P38142	488 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YBR137W	P38276	179 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	COG3	P40094	801 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	GLC8	P41818	229 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	RPE1	P46969	238 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YNL095C	P53932	642 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	MET31	Q03081	177 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	AIM6	Q07716	390 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	RDI1	Q12434	202 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	PPZ1	P26570	692 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	COX13	P32799	129 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	MRPL15	P36523	253 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	SOL2	P37262	315 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	PCL5	P38794	229 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	SHO1	P40073	367 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	SKP1	P52286	194 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	MGA1	P53050	456 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	SED5	Q01590	340 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YDR541C	Q03049	344 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	AIM34	Q03673	198 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	STP3	Q05937	343 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YPR114W	Q06107	315 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	DDI2	P0CH63	225 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	DDI3	P0CH64	225 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	PHO80	P20052	293 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YIM1	P28625	365 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	PMT2	P31382	759 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	MTC7	P32633	139 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	COS8	P38723	381 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	AYR1	P40471	297 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YDL186W	P48568	277 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	RSM23	Q01163	450 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	HRD1	Q08109	551 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	SRL2	Q12020	392 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	SLO1	Q3E784	85 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YAR066W	P0CX18	203 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YHR214W	P0CX19	203 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	RTC2	P38279	296 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	EXO1	P39875	702 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	AIM23	P47015	356 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	BOR1	P53838	576 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	GMC1	Q04399	608 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	TMN2	Q04562	672 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	PLB3	Q08108	686 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	HNT3	Q08702	217 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	SCP1	Q08873	200 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
GPT2	YKR067W	COX3	P00420	269 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.27	□□□□□ -1.57	not detected
GPT2	YKR067W	OAR1	P35731	278 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	RFC2	P40348	353 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	SER33	P40510	469 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	ROG1	P53118	685 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	MSC1	Q03104	513 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	NUP1	P20676	1076 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	URK1	P27515	501 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	CDC5	P32562	705 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	YKR041W	P36134	250 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	YHR033W	P38690	423 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	YHR177W	P38867	453 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPT2	YKR067W	HEM14	P40012	539 aa		5.27	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms