RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C PHO13P19881 312 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RPL5P26321 297 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data1.81□□□□□ -2.12 RIP-Chip
CSE4YKL049C FES1P38260 290 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C KRE29P40026 464 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C GDS1P41913 522 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YRB1P41920 201 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RPC17P47076 161 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C PRO2P54885 456 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C ABZ2Q03266 374 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C KRE28Q04431 385 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C SPC24Q04477 213 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C ATG17Q06410 417 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YPR064WQ12492 139 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C SEY1Q99287 776 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C SAC3P46674 1301 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YRF1-2P40105 1681 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RPL22AP05749 121 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C OM45P16547 393 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C PHO80P20052 293 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RPC25P35718 212 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YET1P35723 206 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C SWD2P36104 329 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C ECM4P36156 370 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YDR089WP38966 869 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C AVT6P40074 448 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C PDS1P40316 373 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C CDC40P40968 455 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C GCN20P43535 752 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C LOH1P47055 219 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C COX16P47081 118 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C VOA1P53262 265 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C BIO4P53630 237 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RTC4P53850 401 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C TIM11P81449 96 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C NNT1Q05874 261 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C PEX30Q06169 523 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C SIA1Q12212 622 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C PRR2Q12310 699 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C OCA6Q12454 224 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C FKS3Q04952 1785 aa1.8□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RPL24AP04449 155 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C BMH1P29311 267 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YBL081WP38180 368 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C MBA1P38300 278 aa1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C PET100P38958 111 aa1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C TMA22P47089 198 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C VMA10P48836 114 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C MIG2P53035 382 aa1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RSM27P53305 110 aa1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C COS6P53344 381 aa1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C ALG9P53868 555 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RGM1Q00453 211 aa1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C EBS1Q03466 884 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C PLP1Q04004 230 aa1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C TAZ1Q06510 381 aa1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C REX3Q12090 404 aa1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C MSH5Q12175 901 aa1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RIO1Q12196 484 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C SAR1P20606 190 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C DPB2P24482 689 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RPS5P26783 225 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C AEP1P32493 518 aa1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RIB7P33312 244 aa1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C BMH2P34730 273 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RBL2P48606 106 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C SYF2P53277 215 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YNL095CP53932 642 aa1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C TMA20P89886 181 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C BCP1Q06338 283 aa1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C CUR1Q06469 252 aa1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C CDD1Q06549 142 aa1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C ABP140Q08641 628 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C TIM22Q12328 207 aa1.78□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C STF1P01098 86 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C ZWF1P11412 505 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C GCN3P14741 305 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C OSM1P21375 501 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C MRPL25P23369 157 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C KRR1P25586 316 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YCR016WP25617 290 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YKL063CP35725 167 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C TRM7P38238 310 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C POP2P39008 433 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C MNN9P39107 395 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YER188WP40103 239 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C OSW5P40219 148 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C AVT7P40501 490 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YPT32P51996 222 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C KAP114P53067 1004 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YKR005CQ02203 525 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YPL077CQ02831 240 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C TLG1Q03322 224 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C DPP1Q05521 289 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C RRG8Q06109 277 aa1.77□□□□□ -2.13
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