RNA–Protein interactions for RNA: YHR122W

CIA2, Transcript of Component of cytosolic iron-sulfur protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene CIA2, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIA2	YHR122W	RRN9	P53437	365 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	NDE2	Q07500	545 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	TMS1	Q12116	473 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YPR096C	O13587	100 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	CBS2	P14905	389 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	NUP2	P32499	720 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
CIA2	YHR122W	OM14	P38325	134 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	TRR2	P38816	342 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	MTC6	P38849	526 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	GAB1	P41733	394 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	TPC1	P53257	314 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	FMN1	Q03778	218 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	ECM18	Q04623	453 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	NAT4	Q04751	285 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	BUR2	Q05949	395 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	FDH1	Q08911	376 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	CDC23	P16522	626 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RPB5	P20434	215 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	STP22	P25604	385 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YCR102C	P25608	368 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	VAM7	P32912	316 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	GPX2	P38143	162 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	TRM5	P38793	499 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YFL067W	P43537	175 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	PAC10	P48363	199 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YDL186W	P48568	277 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	HXT11	P54862	567 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	SPO19	Q03029	223 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RRG8	Q06109	277 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	MDM32	Q12171	622 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	MEC1	P38111	2368 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	MKK1	P32490	508 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	MRPS5	P33759	307 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	TIR2	P33890	251 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YUH1	P35127	236 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YHK8	P38776	514 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	PEX18	P38855	283 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	JLP2	P40206	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	KEL2	P50090	882 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YGR168C	P53293	376 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	INP1	Q03694	420 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	DYN3	Q04949	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIA2	YHR122W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	YKL070W	P36087	169 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	YBR137W	P38276	179 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	RCK1	P38622	512 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
CIA2	YHR122W	COX14	P39103	70 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	RBG1	P39729	369 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	MTW1	P39731	289 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	NCA3	P46955	337 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	APS3	P47064	194 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	WSC2	P53832	503 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	RRN5	Q02983	363 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	SEI1	Q06058	285 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	YPR1	Q12458	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	PSF1	Q12488	208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	MER1	P16523	270 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	IST2	P38250	946 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	MDM31	P38880	579 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	FET3	P38993	636 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	LOH1	P47055	219 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	YGL185C	P53100	379 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	LST7	P53237	242 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIA2	YHR122W	RTT103	Q05543	409 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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