RNA–Protein interactions for RNA: YGR296W

YRF1-3, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-3, Length 5,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-3YGR296W ERV46P39727 415 aa7.27□□□□□ -1.24
YRF1-3YGR296W CDH1P53197 566 aa7.27□□□□□ -1.24
YRF1-3YGR296W COQ10Q08058 207 aa7.27□□□□□ -1.24
YRF1-3YGR296W TMA17Q12513 150 aa7.27□□□□□ -1.24
YRF1-3YGR296W ALY1P36117 915 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YPK2P18961 677 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W PMT2P31382 759 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W HMX1P32339 317 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W DOA4P32571 926 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W TIM12P32830 109 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W HOF1Q05080 669 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W NPC2Q12408 173 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W HXT14P42833 540 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W SPR6Q01684 191 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W SCP1Q08873 200 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W SLO1Q3E784 85 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YLR149CQ99296 730 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W MRPL4P36517 319 aa7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W THR1P17423 357 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W COQ2P32378 372 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W ECT1P33412 323 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W GGC1P38988 300 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W BOL3P39724 118 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W ACS2P52910 683 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W TPN1P53099 579 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W POP6P53218 158 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W ART5P53244 586 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W DET1Q99288 334 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W HOP09932 586 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YMC1P32331 307 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YER010CP40011 234 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W SDH1Q00711 640 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W OST6Q03723 332 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W HRT1Q08273 121 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W LRO1P40345 661 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W PGD1P40356 397 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W BNA7Q04066 261 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W DBP2P24783 546 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W CNE1P27825 502 aa7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W RBG2P53295 368 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W URA3P03962 267 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W FAT1P38225 669 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YHK8P38776 514 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W HIS6P40545 261 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W SDC1Q03323 175 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YCL049CP25577 312 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W ERV15P38312 142 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W ACT1P60010 375 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W ATC1Q04005 294 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YOL107WQ12239 342 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W GSP1P32835 219 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W PRS3P38689 320 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W IRS4P36115 615 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YKR073CP36153 106 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YHR210CP38893 341 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W ICE2P40499 491 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W VPS28Q02767 242 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W ISU1Q03020 165 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YGR161W-CQ3E744 92 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W RPC40P07703 335 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W CLB6P32943 380 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YPS6P40583 537 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W BXI1P48558 297 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W GPI15P53961 229 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W FIT1Q04433 528 aa7.25□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W PPZ2P33329 710 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W LST4P34239 828 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W TED1P40533 473 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W CCC1P47818 322 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W AAT1Q01802 451 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W STE14P32584 239 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W UMP1P38293 148 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W GDS1P41913 522 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W MSY1P48527 492 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W TIM10P87108 93 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YDL176WQ12027 708 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W STS1P38637 319 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W FRE5Q08908 694 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YPL066WQ12194 479 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W TRR1P29509 319 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W LEU5P38702 357 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W HTD2P38790 280 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W SNO3P43544 222 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W NIT3P49954 291 aa7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W LSB5P25369 354 aa7.23□□□□□ -1.25
YRF1-3YGR296W PTC7P38797 343 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.3 ms