RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
DDI1YER143W PET54P10834 293 aa7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W MRPL39P36533 70 aa7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W TIR3P40552 269 aa7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W BUD8P41698 603 aa7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W FMP48P53233 369 aa7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W MTM1P53320 366 aa7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W MRPL19P53875 158 aa7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W LSM7P53905 115 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W MRP51Q02950 344 aa7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W YMR130WQ04223 302 aa7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W ENV7Q12003 364 aa7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data7.78□□□□□ -1.16not detected
DDI1YER143W RRI1Q12468 440 aa7.78□□□□□ -1.16
DDI1YER143W YLR358CO13565 187 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W SED4P25365 1065 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W ATG15P25641 520 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W ACH1P32316 526 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W RCN1P36054 211 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W YMR262WP38430 313 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W CIN2P46670 268 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W LOH1P47055 219 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W RPN14P53196 417 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W AAH1P53909 347 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W SUR7P54003 302 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W BUD25P85052 153 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W YLR352WQ06479 807 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W YPL272CQ08984 517 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W YDL180WQ12301 547 aa7.77□□□□□ -1.17
DDI1YER143W FUR4P05316 633 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W PUP1P25043 261 aa7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W ITR1P30605 584 aa7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W HYM1P32464 399 aa7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W KRE6P32486 720 aa7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W PPG1P32838 368 aa7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W SSH1P38353 490 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W SMB1P40018 196 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W DLS1P40366 167 aa7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W VHT1P53241 593 aa7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W FRE3Q08905 711 aa7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W MCT1Q12283 360 aa7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W ISA2Q12425 185 aa7.76□□□□□ -1.17
DDI1YER143W COX5BP00425 151 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W MES1P00958 751 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W SGA1P08019 549 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W SNC2P33328 115 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W SRL3P36167 246 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W YHR122WP38829 231 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W YIL060WP40519 144 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W CAT5P41735 233 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W CTK2P46962 323 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W PHB2P50085 310 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W POP6P53218 158 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W TNA1P53322 534 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W HHT1P61830 136 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W YDR387CQ04162 555 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W TGS1Q12052 315 aa7.75□□□□□ -1.17
DDI1YER143W GPM1P00950 247 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W CHO1P08456 276 aa7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W PET18P25362 215 aa7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W DBF20P32328 564 aa7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W YBR096WP38256 230 aa7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W SYS1P41544 203 aa7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W MTL1P53214 551 aa7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W SLI1P53304 468 aa7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W SCW4P53334 386 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W MRPS16Q02608 121 aa7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W YAP6Q03935 383 aa7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W YDL218WQ07629 317 aa7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W IZH2Q12442 317 aa7.74□□□□□ -1.17
DDI1YER143W PHO2P07269 559 aa7.73□□□□□ -1.17
DDI1YER143W NAM2P11325 894 aa7.73□□□□□ -1.17
DDI1YER143W MCM1P11746 286 aa7.73□□□□□ -1.17
DDI1YER143W MRPS5P33759 307 aa7.73□□□□□ -1.17
DDI1YER143W API2Q04413 109 aa7.73□□□□□ -1.17
DDI1YER143W RAF1Q06891 181 aa7.73□□□□□ -1.17
DDI1YER143W RPS31P05759 152 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
DDI1YER143W RPL3P14126 387 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
DDI1YER143W ATG22P25568 528 aa7.72□□□□□ -1.17
DDI1YER143W ARO4P32449 370 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
DDI1YER143W MTC7P32633 139 aa7.72□□□□□ -1.17
DDI1YER143W ATF1P40353 525 aa7.72□□□□□ -1.17
DDI1YER143W GPI14P47088 403 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
DDI1YER143W RNH201P53942 307 aa7.72□□□□□ -1.17
DDI1YER143W RSM23Q01163 450 aa7.72□□□□□ -1.17
DDI1YER143W MRPL13Q02204 264 aa7.72□□□□□ -1.17
DDI1YER143W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
DDI1YER143W SPS2P08459 502 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W AFG1P32317 509 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W PPQ1P32945 549 aa7.71□□□□□ -1.18
DDI1YER143W PPZ2P33329 710 aa7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 303 ms