RNA–Protein interactions for RNA: YBL011W

SCT1, Transcript of Glycerol 3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene SCT1, Length 2,280 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCT1	YBL011W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.26	□□□□□ -1.57	not detected
SCT1	YBL011W	ISA2	Q12425	185 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	FAB1	P34756	2278 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	CDC9	P04819	755 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	ADH7	P25377	361 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SRB5	P32585	307 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	YKL075C	P36083	450 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	PHD1	P36093	366 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	MGE1	P38523	228 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	CHS7	P38843	316 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SHO1	P40073	367 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	LTP1	P40347	161 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	FMC1	P40491	155 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	GAT1	P43574	510 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	YJR124C	P47159	448 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	HXT16	P47185	567 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	RNH202	Q05635	350 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	TEN1	Q07921	160 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	IRC10	Q08118	586 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	ATG5	Q12380	294 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	URK1	P27515	501 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	TIP20	P33891	701 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	BNA4	P38169	460 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	GET2	P40056	285 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	PUG1	P40100	303 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	ATF1	P40353	525 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SHR5	P41912	237 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	YJR149W	P47177	404 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SAM37	P50110	327 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	AVT4	P50944	713 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	ERV29	P53337	310 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	IRC15	Q02733	499 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	ATC1	Q04005	294 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SGA1	P08019	549 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	PUP1	P25043	261 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	NUD1	P32336	851 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	MNS1	P32906	549 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.25	□□□□□ -1.57	not detected
SCT1	YBL011W	SDH4	P37298	181 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	TAT1	P38085	619 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	VMA21	P41806	77 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SCW11	P53189	542 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	MKC7	P53379	596 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	FRE4	P53746	719 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	YNL260C	P53846	198 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	CSI2	Q08054	341 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	EAF3	Q12432	401 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	CDC4	P07834	779 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	RML2	P32611	393 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SNC2	P33328	115 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	TAE1	P38340	232 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SAF1	P38352	637 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	TAD2	P47058	250 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SKP1	P52286	194 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	YIP3	P53633	176 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	YMR206W	Q03695	313 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	YPR114W	Q06107	315 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	MCA1	Q08601	432 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	NDD1	Q08887	554 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SAC7	P17121	654 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	MSN1	P22148	382 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	PDE1	P22434	369 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	PEX34	P25584	144 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	SEC17	P32602	292 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	GEX2	P36173	615 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	WSC4	P38739	605 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	COX15	P40086	486 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	LRO1	P40345	661 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	MPM1	P40364	252 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	PRM8	P53174	237 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	YGR168C	P53293	376 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	RSF1	Q05043	376 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	BSP1	Q06604	576 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	THI72	Q08579	599 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	RGT2	Q12300	763 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	PST1	Q12355	444 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	COA6	Q3E846	104 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SCT1	YBL011W	PHO2	P07269	559 aa		5.23	□□□□□ -1.57

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