RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640393.1

RTTN-217, Transcript of rotatin, humanhuman

TSL 5

Gene RTTN, Length 1,357 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTTN-217ENST00000640393 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 TMX3Q96JJ7 454 aa7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MYOCQ99972 504 aa7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CDH19Q9H159 772 aa7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CD248Q9HCU0 757 aa7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 TMEM140Q9NV12 185 aa7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 AP1G1O43747 822 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 SCGB1D2O95969 90 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 AMY1AP04745 511 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 POU2F2P09086 479 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MFSD5Q6N075 450 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 FAM83AQ86UY5 434 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 DRC7Q8IY82 874 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 ST8SIA2Q92186 375 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 KLC2Q9H0B6 622 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 POGKQ9P215 609 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.26□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 DDCP20711 480 aa7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PCSK1P29120 753 aa7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 WASP42768 502 aa7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 FAM47AQ5JRC9 791 aa7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 RNF169Q8NCN4 708 aa7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MIEF2Q96C03 454 aa7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 FAM89AQ96GI7 184 aa7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MSL2Q9HCI7 577 aa7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.25□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 GPR32O75388 356 aa7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MYBP10242 640 aa7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 IL2RBP14784 551 aa7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 VCAM1P19320 739 aa7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CYP2C19P33261 490 aa7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 ALDH1A3P47895 512 aa7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CRHR2Q13324 411 aa7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 Q6ZRM9 215 aa7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 USP45Q70EL2 814 aa7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MRI1Q9BV20 369 aa7.24□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PTH1RQ03431 593 aa7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CCDC157Q569K6 752 aa7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 TFAP2CQ92754 450 aa7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 KCNH6Q9H252 994 aa7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.23□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 BTBD11A6QL63 1104 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 TSPAN6O43657 245 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 OFD1O75665 1012 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PARNO95453 639 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 GUCY1A2P33402 732 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 FLT3LGP49771 235 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CDC42EP1Q00587 391 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 EFCAB12Q6NXP0 572 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 GADL1Q6ZQY3 521 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MDGA1Q8NFP4 955 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 BORCS6Q96GS4 357 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 GPR87Q9BY21 358 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 JAG2Q9Y219 1238 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.22□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 MUSKO15146 869 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 DTNBO60941 627 aa7.21□□□□□ -1.25
RTTN-217ENST00000640393 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms