RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649	TMEM169	Q96HH4	297 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	FGD4	Q96M96	766 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	EHD4	Q9H223	541 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	TOM1L1	O75674	476 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	FTCD	O95954	541 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	CAP2	P40123	477 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	PRCP	P42785	496 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	ALS2CL	Q60I27	953 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	DFFA	O00273	331 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	PLD1	Q13393	1074 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	PKP1	Q13835	747 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	MUM1	Q2TAK8	710 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	GPC2	Q8N158	579 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	CPVL	Q9H3G5	476 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	LCP1	P13796	627 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	SULT1E1	P49888	294 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	PGBD3	Q8N328	593 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	ULK4	Q96C45	1275 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		7.02	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	UPP2	O95045	317 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	SLC2A3	P11169	496 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	ART3	Q13508	389 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	BBS9	Q3SYG4	887 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	ATP8B1	O43520	1251 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	PPFIA2	O75334	1257 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	STMN1	P16949	149 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	CCT5	P48643	541 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	BCAR1	P56945	870 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	GNGT1	P63211	74 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	WASHC5	Q12768	1159 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	MTA1	Q13330	715 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	IPP	Q9Y573	584 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	EXTL3	O43909	919 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	RTN2	O75298	545 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	FGG	P02679	453 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	CLTA	P09496	248 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	OR1G1	P47890	313 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	FBXW4	P57775	412 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	P3H1	Q32P28	736 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	C18orf8	Q96DM3	657 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	SPON2	Q9BUD6	331 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	OCRL	Q01968	901 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	DNER	Q8NFT8	737 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	NFU1	Q9UMS0	254 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	ATP6V1E1	P36543	226 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	THPO	P40225	353 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	COPS2	P61201	443 aa		7.01	□□□□□ -1.29
ACACA-240	ENST00000617649	NCOA4	Q13772	614 aa		7.01	□□□□□ -1.29

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