RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 TMEM132DQ14C87 1099 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CENPKQ9BS16 269 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 VPS11Q9H270 941 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 PRR12Q9ULL5 1215 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SUFUQ9UMX1 484 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 MAGEB2O15479 319 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 NR3C2P08235 984 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 COPS2P61201 443 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 RBP5P82980 135 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TMPRSS15P98073 1019 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TMEM62Q0P6H9 643 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 KRT80Q6KB66 452 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 RMDN1Q96DB5 314 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 BPIFA3Q9BQP9 254 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 GUCY1A2P33402 732 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ACAD11Q709F0 780 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 RHOT1Q8IXI2 618 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 RMDN2Q96LZ7 410 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 EGFL8Q99944 293 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TSSK1BQ9BXA7 367 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 WASHC5Q12768 1159 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 FBXO41Q8TF61 875 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 APOL1O14791 398 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 NTSR2O95665 410 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 OCM2P0CE71 109 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ITGA4P13612 1032 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 RAPGEF5Q92565 580 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 WNT8AQ9H1J5 351 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 DNAJC6O75061 913 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CPT1AP50416 773 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 FCGRTP55899 365 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 GTF2H3Q13889 308 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 FSCBQ5H9T9 825 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 UNC13BO14795 1591 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ATICP31939 592 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 HSD17B4P51659 736 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 MAP3K7CLP57077 242 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 POU5F1BQ06416 359 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SEMA3FQ13275 785 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 EMC2Q15006 297 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SNX17Q15036 470 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 DGKDQ16760 1214 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CLEC10AQ8IUN9 316 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CHST13Q8NET6 341 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 MTBPQ96DY7 904 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 COG4Q9H9E3 785 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.59□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 PIK3R2O00459 728 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 PDXKO00764 312 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 RFC5P40937 340 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 CDH6P55285 790 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ST8SIA6P61647 398 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 SLC15A2Q16348 729 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 EPAS1Q99814 870 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 PLAAQ9Y263 795 aa11.58□□□□□ -0.55
TNS1-221ENST00000615025 PRRG1O14668 218 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 NR1D1P20393 614 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 KCNA1Q09470 495 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 ACOT2P49753 483 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 TPI1P60174 286 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 ITPK1Q13572 414 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 GPS1Q13098 491 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 SPARCL1Q14515 664 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 SLC38A7Q9NVC3 462 aa11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
TNS1-221ENST00000615025 EFCAB14O75071 495 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms