RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 PPP2R5CQ13362 524 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 BLIDQ8IZY5 108 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 RNF149Q8NC42 400 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 NETO1Q8TDF5 533 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 FGF13Q92913 245 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 CDC45O75419 566 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 ERLIN2O94905 339 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 HSPA4P34932 840 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 RFC5P40937 340 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 EVCP57679 992 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 SPEM2Q0P670 501 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 EMC2Q15006 297 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 INF2Q27J81 1249 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 USP41Q3LFD5 358 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 FUT10Q6P4F1 479 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 FERMT3Q86UX7 667 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 ITFG1Q8TB96 612 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 CPB2Q96IY4 423 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 NELL2Q99435 816 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 PPME1Q9Y570 386 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 MTAPQ13126 283 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 AIFM3Q96NN9 605 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 KXD1Q9BQD3 176 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 LXNQ9BS40 222 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 APOL6Q9BWW8 343 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.72□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 NCAM2O15394 837 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 ASAP2O43150 1006 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 LRP3O75074 770 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 P4HBP07237 508 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 AXLP30530 894 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 HOXA9P31269 272 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 CREMQ03060 361 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 AMHR2Q16671 573 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 NOTUMQ6P988 496 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 C4orf19Q8IY42 314 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 TCP11Q8WWU5 503 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 RABGGTAQ92696 567 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 CCDC51Q96ER9 411 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 CSRNP2Q9H175 543 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 NOTCH4Q99466 2003 aa14.71□□□□□ -0.05
CTIF-211ENST00000592658 ATRXP46100 2492 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 ZBTB39O15060 712 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 NR1I2O75469 434 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 DEXIO95424 95 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 RETP07949 1114 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 POU2F2P09086 479 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 PTENP60484 403 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 ADCY1Q08828 1119 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 EPHA7Q15375 998 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 RTP2Q5QGT7 225 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 FAM20AQ96MK3 541 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 MTRQ99707 1265 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 RGL1Q9NZL6 768 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.7□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.69□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 CCL16O15467 120 aa14.69□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 ECI2O75521 394 aa14.69□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 C8AP07357 584 aa14.69□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 AKAP5P24588 427 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms