RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 GCNT1Q02742 428 aa24.19■■□□□ 1.46
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USP36-218ENST00000590546 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 SHC3Q92529 594 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 TCHPQ9BT92 498 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 FZD8Q9H461 694 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 H3BRB1 525 aa24.19■■□□□ 1.46
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USP36-218ENST00000590546 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 HELQQ8TDG4 1101 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 CGRRF1Q99675 332 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 AGPAT1Q99943 283 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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USP36-218ENST00000590546 SNX12Q9UMY4 172 aa24.19■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
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USP36-218ENST00000590546 MCL1Q07820 350 aa24.18■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.18■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.18■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
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USP36-218ENST00000590546 OGTO15294 1046 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 BUB1O43683 1085 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 MMP3P08254 477 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 SLC10A3P09131 477 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 C17orf99Q6UX52 265 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 KREMEN1Q96MU8 473 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 PACSIN1Q9BY11 444 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 HYOU1Q9Y4L1 999 aa24.17■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 EDN1P05305 212 aa24.16■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 CLCN3P51790 818 aa24.16■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 TNFAIP2Q03169 654 aa24.16■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 FAM187BQ17R55 369 aa24.16■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 TEX35Q5T0J7 233 aa24.16■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 IFNL1Q8IU54 200 aa24.16■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.16■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 ZNF516Q92618 1163 aa24.16■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 NLRP4Q96MN2 994 aa24.16■■□□□ 1.46
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USP36-218ENST00000590546 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa24.16■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 SREBF2Q12772 1141 aa24.16■■□□□ 1.46
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USP36-218ENST00000590546 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.16■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 CCDC102AQ96A19 550 aa24.16■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.15■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 TMEM253P0C7T8 217 aa24.15■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 PROZP22891 400 aa24.15■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 IGBP1P78318 339 aa24.15■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 BIRC3Q13489 604 aa24.15■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 RNF14Q9UBS8 474 aa24.15■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.15■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.14■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 ZNF286BP0CG31 522 aa24.14■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 USP8P40818 1118 aa24.14■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.14■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.14■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 WDR49Q8IV35 697 aa24.14■■□□□ 1.46
USP36-218ENST00000590546 OLIG1Q8TAK6 271 aa24.14■■□□□ 1.46
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USP36-218ENST00000590546 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
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USP36-218ENST00000590546 FAM189A1O60320 539 aa24.14■■□□□ 1.45
USP36-218ENST00000590546 PALMO75781 387 aa24.14■■□□□ 1.45
USP36-218ENST00000590546 HLA-DRAP01903 254 aa24.14■■□□□ 1.45
USP36-218ENST00000590546 TUBBP07437 444 aa24.14■■□□□ 1.45
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USP36-218ENST00000590546 PIK3CAP42336 1068 aa24.14■■□□□ 1.45
USP36-218ENST00000590546 GALCP54803 685 aa24.14■■□□□ 1.45
USP36-218ENST00000590546 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.14■■□□□ 1.45
USP36-218ENST00000590546 PPFIA1Q13136 1202 aa24.14■■□□□ 1.45
USP36-218ENST00000590546 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
USP36-218ENST00000590546 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.14■■□□□ 1.45
USP36-218ENST00000590546 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
USP36-218ENST00000590546 USP6NLQ92738 828 aa24.14■■□□□ 1.45
USP36-218ENST00000590546 KAT5Q92993 513 aa24.14■■□□□ 1.45
USP36-218ENST00000590546 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.14■■□□□ 1.45
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